r - 如何最小化 R 包的安装大小

Question

在我的工作场所，我们正在为不同版本的 R 安装大量库。所需的大小正在迅速增加。我该怎么做才能尽可能减少每次安装？我知道 --no-docs 并且我需要 --with-keep.source

编辑:这是对我的设置的快速研究

我在 /tmp/library 中复制了我的库

library(fs)                                                                             
library(data.table)                                                                     
library(stringr)
lib_dir <- "/tmp/library"                                                               
pkgs <- dir_ls(lib_dir)
dirs <- dir_info(pkgs, recurse = TRUE)[,1:3]                                            
setDT(dirs)
dirs <- dirs[type != "directory"]

# ==> We can see files at the root of each library take 12M in aggreagte <==
dirs[depth == 4, .(size = sum(size))]
#    size
# 1:  12M

dirs[, depth := str_count(path, "/")]
dirs[, pkg := file.path(lib_dir, str_match(path, sprintf("%s/(.*?)/.*", lib_dir))[,2L])]
dirs[depth > 4L, pkg_dir := str_match(path, sprintf("%s/(.*?)/.*", pkg))[,2L]]

# ==> The worst offenders are indeed libs, and lib is also large <==
dirs[depth > 4, .(size = sum(size)), pkg_dir][order(-size)][1:10]
#     pkg_dir    size
#  1:    libs 610.77M
#  2: include 144.18M
#  3:     doc 140.93M
#  4:     lib 104.58M
#  5:       R  91.31M
#  6:    help  61.78M
#  7:    html  51.02M
#  8:    data   25.9M
#  9:    java  11.74M
# 10:     www   8.38M

然后我在 libs 和 lib 上运行 strip --strip-debug 以达到以下目的

dirs[depth > 4, .(size = sum(size)), pkg_dir][order(-size)][1:10]
#         pkg_dir    size
#  1:     include 144.18M
#  2:         doc 140.93M
#  3:        libs  95.24M
#  4:           R  91.31M
#  5:        help  61.78M
#  6:        html  51.02M
#  7:        data   25.9M
#  8:        java  11.74M
#  9:         www   8.38M
# 10: htmlwidgets   8.24M

从上面的示例中我有以下问题:docs 似乎包含我可以通过 browseVignettes() 访问的小插曲 我不需要这个，但我仍然需要 help("stuff") 开始工作。

• 我可以使用 --no-docs 或 --no-help 来实现吗(我试过但是运行 R CMD INSTALL --no-docs --no-html xtable 仍然生成 pdf 和 html 文件)？
• 在不失去基本功能的情况下，还有什么我可以节省的吗？

Answer 1

Dirk EddelBuettel 在 2017 年写了两篇博文，这里很难总结。 R 包很大，但它不是来自文档或源代码。它来自二进制文件是使用调试符号编译的事实。这个想法是用更具体的选项自己编译包，以摆脱二进制文件中无用的东西。对于带有编译代码的包来说， yield 非常显着(空间减少 4-5 倍)

• http://dirk.eddelbuettel.com/blog/2017/08/14/#009_compact_shared_libraries
• http://dirk.eddelbuettel.com/blog/2017/08/20/#010_stripping_shared_libraries