r - 依赖包 "package_name"不可用

Question

尝试在RStudio中构建和重新加载时出现一个奇怪的错误。在我的描述文件中，我包含了一个在组织内构建和维护的软件包。它不在CRAN上。本质上，当我更新DESCRIPTION文件(取决于:...)时，出现以下错误:

==> devtools::document(roclets=c('rd', 'collate', 'namespace', 'vignette'))

Updating fczstudy documentation
Loading fczstudy
Error in (function (dep_name, dep_ver = NA, dep_compare = NA)  : 
  Dependency package surv3 not available.
Calls: suppressPackageStartupMessages ... <Anonymous> -> load_all -> load_depends -> mapply -> <Anonymous>
Execution halted

在这种情况下， surv3是我在组织内维护的软件包-我可以确认它确实已安装，因为我正在使用它。

CRAN的其他软件包似乎没有发生这种情况。它是几天前才开始的。不允许我导入我的软件包(surv3)

我真的不确定如何调试它。

Ctrl + Shift + B后控制台中的 traceback()不返回任何内容

这是我的 sessionInfo():

R version 3.2.0 (2015-04-16)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 8 x64 (build 9200)

locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252 
[2] LC_CTYPE=English_United States.1252   
[3] LC_MONETARY=English_United States.1252
[4] LC_NUMERIC=C                          
[5] LC_TIME=English_United States.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods  
[7] base     

other attached packages:
[1] surv3_1.01     knitr_1.11     fczstudy_0.1.0 dplyr_0.4.3   
[5] ggplot2_1.0.1 

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] Rcpp_0.12.1      assertthat_0.1   digest_0.6.8    
 [4] MASS_7.3-40      R6_2.1.1         grid_3.2.0      
 [7] plyr_1.8.3       gtable_0.1.2     DBI_0.3.1       
[10] magrittr_1.5     scales_0.3.0     stringi_0.5-5   
[13] lazyeval_0.1.10  reshape2_1.4.1   rmarkdown_0.8.1 
[16] proto_0.3-10     tools_3.2.0      stringr_1.0.0   
[19] munsell_0.4.2    yaml_2.1.13      parallel_3.2.0  
[22] colorspace_1.2-6 htmltools_0.2.6 

Answer 1

布兰登的解决方案对我不起作用。但是，我发现，如果在加载程序包后运行document，那么它不会引发错误。同样，即使抛出错误，它似乎仍在更新程序包。因此，可以通过以另一种顺序运行代码来解决该问题。
我查看了document函数的源代码，并将错误消息跟踪到requireNamespace调用。事实证明，该软件包根本没有丢失，但是.onLoad函数调用中有一个错误。这将导致requireNamespace返回FALSE(无法加载软件包)，与未安装软件包相同。因此，真正的问题是，在这种特殊情况下，来自document的错误消息是不正确的。
错误示例:

Browse[2]> requireNamespace("thepackage")
Loading required namespace: thepackage
Failed with error:  ‘.onLoad failed in loadNamespace() for 'thepackage', details:
  call: some_function(., some_variable)
  error: could not find function "some_function"’