unix - 使用 grep 提取列

Question

我有一个超过 100 列的数据框，每列都标有一个唯一的字符串。第 1 列代表索引变量。我想使用一个基本的 UNIX 命令来提取索引列(第 1 列)+ 使用 grep 的特定列字符串.

例如，如果我的数据框如下所示:

Index  A  B  C...D  E  F
p1     1  7  4   2  5  6
p2     2  2  1   2  .  3
p3     3  3  1   5  6  1

我想使用一些命令来仅提取列“X”，我将使用 grep 指定它，并同时显示第 1 列和第 I 列 grep 'd。我知道我可以使用 cut -f1 myfile第一点，但需要 grep 的帮助每列。作为一个更具体的例子，如果我的 grep短语是“B”，我希望输出为:

Index  B
p1     7
p2     2
p3     3

我是 UNIX 新手，在类似示例中没有找到太多。任何帮助将非常感激!!

Answer 1

您需要使用 awk:

awk '{print $1,$3}' <namefile>

这个简单的命令允许打印文件的第一 ($1) 和第三 ($3) 列。软件 awk 实际上要强大得多。我认为你应该看看 awk 的手册页。

一个不错的组合是使用带有管道的 grep 和 awk。以下代码将仅打印文件中包含“p1”的行的第 1 列和第 3 列:

grep 'p1' <namefile> | awk '{print $1,$3}'

相反，如果您想按行号选择行，则可以将 grep 替换为 sed:

sed 1p <namefile> | awk '{print $1,$3}'

实际上，在所有示例中都可以单独使用 awk:

awk '/p1/{print $1,$3}' <namefile> # will print only lines containing p1
awk '{if(NR == 1){print $1,$3}}' <namefile> # Will print only first line