R 不会将行附加到文件(使用 Cat 或 Write)

Question

我尝试了 stackoverflow 中的一些选项(例如 1 )，但这也不起作用，所以我的代码中可能存在错误:

 fileConn<-file("outputR.txt")
for (i in 1:length(lines)){
  line = lines[i]
  fields = strsplit(line, "\t")[[1]]
  id = fields[1]
  goIDs = fields[2:length(fields)]
  list = as.list(GOCCANCESTOR[goIDs])
  text = paste(toString(id), ":", toString(goIDs))
  cat(text, file=fileConn, append=TRUE, sep = "\n")

}
close(fileConn)

当我运行这段代码时，它会不断覆盖 outputR.txt 文件中的数据。有什么解决这个问题的建议吗？

Answer 1

问题是您将 Fileconnection 与 cat 结合使用，然后追加将不起作用。您可以使用几个选项，最简单的一个是这个:
首先“创建”文件，如果你想添加一个标题，例如:

header = "some header" 
## if you don't want to use a header then leave the header blank
header =""
cat(text, file="outputR.txt", append=FALSE, sep = "\n")

注意 append = FALSE 如果你想清除文件，如果它已经存在，这是必要的，否则你必须使用 append = TRUE
您可以使用以下方式向其写入文本:

text = text = paste(toString(id), ":", toString(goIDs))
cat(text file="outputR.txt", append=TRUE, sep = "\n")