r - 比较r中四个ROC曲线的auc

Question

我想比较R中四个roc曲线的auc。我试过 roc.test ，但是这个函数只能比较两条曲线

roc.test(roc1,roc2)

R有比较四条曲线的功能吗？我知道在 stata 中我可以通过 roccomp 比较 4 条曲线。有谁知道如何比较 R 中的四条曲线？

谢谢!!

Answer 1

我不认为它与 roc.test 一起存在，但您可以使用 library(caTools) 来完成它。

使用 'sapply' 和 library(pROC) 比较 AUC 值非常容易，我在这里描述了这两种方法:

两种方法的示例和设置:

在此处构建模型:

    lm1 <- lm(am ~ disp + mpg, data= mtcars)
    lm2 <- lm(am ~ disp + hp, data= mtcars)
    lm3 <- lm(am ~ disp + wt, data= mtcars)

在这里预测模型:

predict1 <- predict(lm1, newdata=mtcars)
predict2 <- predict(lm2, newdata=mtcars)
predict3 <- predict(lm3, newdata=mtcars)

方法一:

library("caTools")
colAUC(cbind(predict1, predict2, predict3), mtcars$am, plotROC = T)

输出:

                 [,1]      [,2]      [,3]
    0 vs. 1 0.8380567 0.9433198 0.9433198

如果您选择使用 plotROC = T，那么您将收到 ROC 之间的绘图比较

方法2:

auc.val <- sapply(list(predict1, predict2, predict3),function(x)roc(pred=x,resp=mtcars$am)$auc)

最后在这里使用 sapply 计算 AUC:

library(pROC)
auc.val <- sapply(list(predict1, predict2, predict3),function(x)roc(pred=x,resp=mtcars$am)$auc)

会返回这个:

> auc.val
[1] 0.8380567 0.9433198 0.9433198

如果你有兴趣用名字打印这个，在 sapply 中使用 USE.NAMES

> auc.val <- sapply(list("lm1" = predict1, "lm2" = predict2,"lm3"= predict3),function(x)roc(pred=x,resp=mtcars$am)$auc, USE.NAMES = T)
> auc.val
      lm1       lm2       lm3 
0.8380567 0.9433198 0.9433198