mpi - 如何在 MPI 代码上从 gprof 获得有意义的结果？

Question

我正在优化 MPI 代码并且正在使用 Gprof。
问题是我得到的结果完全不合理。我的工作流程如下:

编译代码添加-pg作为编译标志。

运行代码 mpirun -np Nproc EXEC.exe arg1 ... argN .

在可执行文件上运行 gprof gprof EXEC.exe

这有什么问题？

Answer 1

运行说明gprof通常假设程序是串行的，或单进程但多线程的。

运行 gprof使用像 MPI 程序这样的多进程程序，你会想要

确保每个进程输出自己的文件

跨进程显式汇总文件

运行 gprof在结果上。

This blog post或 these instructions at LLNL是很好的起点:

设置记录不佳的 GMON_OUT_PREFIX环境变量，例如在 bash 中，export GMON_OUT_PREFIX=gmon.out-在运行 mpiexec 命令之前(然后，根据环境，您可能必须运行 mpirun -x GMON_OUT_PREFIX -np Nproc EXEC.exe arg1 ... argN 以确保每个进程都有环境变量)

使用 gprof 本身对结果进行收集和求和，gprof -s EXEC.exe gmon.out-*

gprof EXEC.exe gmon.sum (或者只检查单个文件，或一起检查文件，使用 gprof EXEC.exe gmon.out-12345 或 gprof EXEC.exe gmon.out-* )