merge - 如何在 ImageJ 中将不同的堆栈合并在一起？

Question

我正在尝试找出一种将两个堆栈合并在一起的方法。例如，我拍摄了一些关于神经元胞体的 60X 图像，然后我将以 60X 拍摄另一组基底树突。那我怎样才能将它们组合在一起呢？

Answer 1

组合堆栈

您可能想要创建一个合成图像，每个图像堆栈构成组合的多 channel 图像中的一个 channel 。您可以使用 Merge Channels 执行此操作命令:

只需分别打开每个图像堆栈，然后运行 ​​Image > Stack > Merge Channels...，将每个图像堆栈分配给所需的 channel 。结果将是每个相应平面的合成。

或者，如果您的意思是以某种数学方式合并每个平面(虽然我猜不是)，Image Calculator命令可以使用各种操作组合两个堆栈:

图像配准/对齐

我还猜测您的图像需要先进行配准，特别是因为您使用 alignment 标记了这个问题。

Fiji ImageJ 的分发有几个很好的工具，包括:

• Align Image by line ROI (简单/容易/快速)
• Landmark Correspondences和 BUnwarpJ (发烧友)
• TrakEM2 (强大的重型解决方案)
• StackReg也很受欢迎

参见 Fiji wiki对于其他选项，也是如此。