awk - 如何使用 awk 计算总和并替换文件中的列

Question

我是网站和编程界的新手，希望您有时间帮助我。我的问题如下:我有一个包含多个列的文件。在第二列中有值。我试图计算给定数字的每个值的总和，并将第二列替换为包含总和结果的新列。这是我的输入示例:

A B C
x 1 t
y 2 u
z 3 v

我想将 B 列中的值相加为 5 并获得如下所示的输出:

A B C
x 6 t
y 7 u
z 8 v

我尝试失败的代码是

zcat my_file.vcf.gz| tail -n +49 | awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"} {print $0, $2+5}'>my.output.vcf

提前致谢

Answer 1

我们可以避免使用 tail，因为打印第 49 行的行可以在 awk 本身中处理。您还需要在第二个字段中添加值，然后您可以通过 print 命令打印整行。

重要的一点，根据 OP 的示例，如果第二个字段有字母表，则无需在其中添加 5，因此请在此处处理该情况。

zcat my_file.vcf.gz | 
awk '
  BEGIN{ FS=OFS="\t" }
  FNR>=49{
    $2=($2~/[a-zA-Z]/?$2:$2+5)
    print
  }
' > my.output.vcf