r - 分离 R 包以升级它的可靠过程是什么？

Question

我编写了一个使用 devtools 来包含内部数据的包:

devtools::use_data(.data, internal = T, overwrite = T)

我最近更改了该数据并重建了包。我想在另一台当前加载了旧包的机器上升级该包:

detach('package:myPackage', unload=T)
remove.packages('myPackage')
install.packages(repos=NULL, 'myPackage.zip')

我检查更改是否已经完成:

length(myPackage:::.data[[1]])
[1] 2169

不是我所期望的......也许重启会有所帮助？

Restarting R session...
length(myPackage:::.data[[1]])
[1] 2179

这是预期的结果。

阅读 的帮助分离 表明在某些情况下它可能是片状的，例如:

如果在加载了命名空间的包上使用 library，它会附加已加载命名空间的导出。因此，分离和重新附加包可能不会刷新包的部分或全部组件，这是不可取的。

我的情况是我想完全清除加载的包，以便我可以更新它。有没有办法在不重新启动 R 的情况下做到这一点？

编辑 2016/10/28 - 更新了下面的可重现示例

在 Windows 上测试

需要开发工具

...

# setup package in temp dir
pkg_dir <- file.path(tempfile(), 'dummy.test.pkg')
dir.create(pkg_dir, recursive=T)
devtools::create(pkg_dir)
setwd(pkg_dir)

# read description
desc <- readChar('DESCRIPTION', file.size('DESCRIPTION'))

# create and build package v01
.testval <- c(1,2,3)
devtools::use_data(.testval, internal=T, overwrite=T)
v01 <- sub('\\d+\\.\\d+\\.\\d+\\.\\d+', '0.0.0.1', desc, perl=T)
writeChar(v01, 'DESCRIPTION')
bin01 <- devtools::build(binary=T, path='.')

# create and build package v10
.testval <- c(4,5,6)
devtools::use_data(.testval, internal=T, overwrite=T)
v01 <- sub('\\d+\\.\\d+\\.\\d+\\.\\d+', '1.0.0.0', desc, perl=T)
writeChar(v01, 'DESCRIPTION')
devtools::build(binary=T, path='.')
bin10 <- devtools::build(binary=T, path='.')

# up to this point we haven't loaded either package
sessionInfo()

# install v01
install.packages(repos=NULL, bin01)
cat(dummy.test.pkg:::.testval)
# 1 2 3 (as expected)

# unload the package
unloadNamespace('dummy.test.pkg')

# install v10
install.packages(repos=NULL, bin10)
cat(dummy.test.pkg:::.testval)
# 1 2 3 (NOT 4 5 6 which we expected)

### restart R here ###
cat(dummy.test.pkg:::.testval)
# 4 5 6 (as expected)

Answer 1

您正在寻找 unloadNamespace .我一直将它用于您描述的确切目的。

只需按顺序调用:

# this may fail, see below
unloadNamespace("mypackage")
# if it succeeds you're all good

# updating the package
install.packages("mypackage")

# reloading the updated package
library("mypackage")

我从来没有遇到过任何问题，无论是从源/二进制安装，从本地/CRAN/github，有/没有 Packrat 等。

编辑:这不能解决 OP 的特定问题，即更新包数据。然而，它适用于大多数简单的情况，例如更新一些 R 代码，所以我将答案留给 future 的读者。

但是，可能发生的情况是目标包实际上是由当前加载的其他包导入的。在这种情况下，卸载失败。

例如，我知道这会在我当前的 session 中失败:

> unloadNamespace("magrittr")
Error in unloadNamespace("magrittr") : 
  namespace ‘magrittr’ is imported by ‘stringr’, ‘customFunctions’, ‘dplyr’, ‘tidyr’ so cannot be unloaded

这里的解决方案是首先卸载(使用 unloadNamespace )所有导入“mypackage”的包。

如果有很多导入包，你实际上只需重启 R 就可以节省时间。(因为你似乎在谈论自定义本地包，这可能不会发生在你身上，除非你写了其他依赖它的包。)