r - R 中是否有对 dist 函数的稀疏支持？

Question

有没有人听说过任何与 dist{stats} 相同的包或功能？来自 R 的函数，它创建了

distance matrix that is computed by using the specified distance measure to compute the distances between the rows of a data matrix,

但是将一个散列矩阵作为输入？

我的 data.frame(名为 dataCluster)有暗淡:7000 X 10000 并且几乎是 99% 稀疏。在不稀疏的常规形式中，此功能似乎不会停止工作......

h1 <- hclust( dist( dataCluster ) , method = "complete" )

没有答案的类似问题:
Sparse Matrix as input to Hierarchical clustering in R

Answer 1

您要 wordspace::dist.matrix .

它接受来自 Matrix 的稀疏矩阵包(从文档中不清楚)，也可以做交叉距离，输出 Matrix和 dist对象等等。

默认距离度量是 'cosine'但是，请务必指定 method = 'euclidean'如果你想要那个。