R包依赖

Question

我正在尝试构建一个 R 包，但似乎包依赖项存在一些问题。如果我在 R 中运行代码，我需要包“rgdal”和“rgeos”，所以为了从中创建包，我:

在 NAMESPACE 文件中添加了“import(rgdal, rgeos)”行

在描述文件

中添加了“Depends: rgeos, rgdal”行

当我运行 R CMD 检查(构建后)时，我收到一个错误消息:

* checking package dependencies ... ERROR
Benötigte, aber nicht verfügbare Pakete:
  'rgeos' 'rgdal'

See the information on DESCRIPTION files in the chapter 'Creating R
packages' of the 'Writing R Extensions' manual.

德语部分的错误:“Benötigte, aber nicht verfügbare Pakete:” = “需要，但没有可用的包”。

我已阅读上述手册并了解使用导入、建议或增强的选项，但我很确定这取决于我必须使用的选项，因为在我的代码功能中，我使用的是外部功能这两个包。

我做错了什么？

Answer 1

R 认为您的系统上没有这些软件包。

现在你当然知道你这样做了。有什么区别？

那么你可能将它们安装在另一个目录中 R CMD check不看。解决此问题的一种方法在“R Internals”手册(引用“Writing R Extensions”)的第 7 节“工具”中描述，并使用文件 ~/.R/checkEnviron设置在 R CMD check 期间使用的环境变量.

例如，我有

# edd Apr 2003  Allow local install in /usr/local, also add a directory for
#               Debian packaged CRAN packages, and finally the default dir 
# edd Jul 2007  Now use R_LIBS_SITE, not R_LIBS
R_LIBS_SITE=${R_LIBS_SITE-'/usr/local/lib/R/site-library:'
                          '/usr/lib/R/site-library:/usr/lib/R/library'}

我刚刚打破了一条长线(中间没有两个撇号)。