r - 在 ggplot 中平滑

Question

我有这个 ggplot

ggplot(dt.1, aes(x=pctOAC,y=NoP, fill=Age)) +
    geom_bar(stat="identity",position=position_dodge()) +
    geom_smooth(aes(x=pctOAC,y=NoP, colour=Age), se=F, method="loess",show_guide = FALSE,lwd=0.7) +
    theme(legend.position=c(.2,0.8))

dt1 <- structure(list(Age = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L), .Label = c("o80", "u80"), class = "factor"), NoP = c(47L, 5L, 33L, 98L, 287L, 543L, 516L, 222L, 67L, 14L, 13L, 30L, 1L, 6L, 17L, 30L, 116L, 390L, 612L, 451L, 146L, 52L), pctOAC = c(0, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 0, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100)), .Names = c("Age", "NoP", "pctOAC"), row.names = c(NA, -22L), class = "data.frame")

我希望平滑线被限制在零以上，也许类似于内核密度。事实上如果我 有 底层数据，我预计内核密度为 正好我想要什么，但我只有汇总数据。有没有办法做到这一点？我尝试使用不同的 method=在 geom_smooth ，但小数据集似乎阻止了它。我想知道如何使用 stat_function但我对如何继续寻找合适的函数进行绘图没有太多线索。

Answer 1

另一种可能性是使用 method="glm"带有样条曲线和对数链接(即也尝试过 method="gam" ，但它的自动复杂度调整想要减少太多的摆动:

library(splines)
ggplot(dt.1, aes(x=pctOAC,y=NoP, fill=Age)) +
    geom_bar(stat="identity",position=position_dodge()) +
    geom_smooth(aes(colour=Age), se=F,
                method="glm",
                formula=y~ns(x,8),
                family=gaussian(link="log"),
                show_guide = FALSE,lwd=0.7) +
    theme(legend.position=c(.2,0.8))