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我正在尝试合并(加入)多个数据表(通过 fread 从 5 个 csv 文件中获得)以形成一个数据表。当我尝试合并 5 个数据表时出现错误,但当我只合并 4 个时工作正常。 MWE 如下:
# example data
DT1 <- data.table(x = letters[1:6], y = 10:15)
DT2 <- data.table(x = letters[1:6], y = 11:16)
DT3 <- data.table(x = letters[1:6], y = 12:17)
DT4 <- data.table(x = letters[1:6], y = 13:18)
DT5 <- data.table(x = letters[1:6], y = 14:19)
# this gives an error
Reduce(function(...) merge(..., all = TRUE, by = "x"), list(DT1, DT2, DT3, DT4, DT5))
Error in merge.data.table(..., all = TRUE, by = "x") : x has some duplicated column name(s): y.x,y.y. Please remove or rename the duplicate(s) and try again.
# whereas this works fine
Reduce(function(...) merge(..., all = TRUE, by = "x"), list(DT1, DT2, DT3, DT4))
x y.x y.y y.x y.y
1: a 10 11 12 13
2: b 11 12 13 14
3: c 12 13 14 15
4: d 13 14 15 16
5: e 14 15 16 17
6: f 15 16 17 18
setnames(DT1, "y", "new_y")
# this works now
Reduce(function(...) merge(..., all = TRUE, by = "x"), list(DT1, DT2, DT3, DT4, DT5))
最佳答案
这是一种将计数器保持在 Reduce
内的方法, 如果要在合并期间重命名:
Reduce((function() {counter = 0
function(x, y) {
counter <<- counter + 1
d = merge(x, y, all = T, by = 'x')
setnames(d, c(head(names(d), -1), paste0('y.', counter)))
}})(), list(DT1, DT2, DT3, DT4, DT5))
# x y.x y.1 y.2 y.3 y.4
#1: a 10 11 12 13 14
#2: b 11 12 13 14 15
#3: c 12 13 14 15 16
#4: d 13 14 15 16 17
#5: e 14 15 16 17 18
#6: f 15 16 17 18 19
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