r - 在不使用外部工具的情况下使用大型数据集时，我可以减少 knitR/ggplot2 中的 pdf 文件大小吗？

Question

我有许多大型文件，我正在 rmarkdown 文档中将它们读入 R，进行清理，并使用 ggplot2 进行绘图。

大多数文件的大小约为 3Mb，包含大约 80,000 行数据，但有些文件大小为 12Mb，包含 318,406 行数据(时间、扩展名、强制)。

    Time,Extension,Load
    (sec),(mm),(N)
    "0.00000","0.00000","-4.95665"
    "0.00200","0.00000","-4.95677"
    "0.00400","0.00000","-4.95691"
    "0.10400","-0.00040","-4.95423"

翻阅数据并创建 pdf 文件需要一段时间(没关系)，但现在 PDF 文件大小接近 6Mb，其中包含大约 16 个图形(实际上 3 个图形是使用 ggplot2 的分面图)。

我知道 pdf 为我的数据集中的每个数据点都包含了一个线段，因此随着我增加图形数量，文件中的数据量也会增加。/但是，我不认为需要深入到pdf 文档以查看该级别的详细信息，当它接近 10Mb 时，我将无法通过电子邮件发送它)。

如果我使用 pdf2ps 将 pdf 转换为 ps，然后使用 ps2pdf 返回 pdf，我得到的文件大约是原始 pdf 大小的 1/3，并且质量看起来很棒。

因此，R/knitR/ggplot2 中是否有一种方法可以减少 pdf 图像中绘制的点数 没有 使用外部工具压缩 pdf 文件？ (或以某种方式优化生成的 pdf ？)

干杯
皮特

Answer 1

您可以尝试通过添加将图形设备从 pdf 更改为 png

knitr::opts_chunk$set(dev = 'png')

到您的设置块。

或者您可以将其添加到您的输出标题

output:
  pdf_document:
    dev: png

尝试不同的设备(png、jpg)。也许这会改变大小