stan - 重新编译以避免 R session 崩溃

Question

如何避免重新编译？

我的 stan()正在重新编译以避免 R session 崩溃。

为了验证我的模型，我想为来自已知分布的许多数据复制各种模型。然而rstan::stan()总是重新编译我的 stan 文件，所以花了很长时间。如何避免重新编译。

编辑评论-------------

转换备忘录 rstan::stan()至 rstan::sampling() .

在 rstan::stan ，其变量名是 model_name

 m <- "foo.stan"
 rstan::stan( model_name =m, data =...)

另一方面，在 rstan::sampling它的变量名是 object

   m <- "foo.stan"
   m <- stan_model(m)
   rstan::sampling( object = m , data = ...)

请小心!!变量名不同!!

Answer 1

使用函数stan_model编译，然后使用 sampling 中编译的模型输出功能。例如:

m <- stan_model('foo.stan')
fit <- sampling(m, data = ...)

代替

fit <- stan('foo.stan', data = ...)