r - DiagrammeR 和 R Markdown pdf : Remove space around diagram?

Question

我在使用 R Markdown 中的包 DiagrammeR 并将 pdf 指定为输出时遇到了很多问题。我设法显示了图表，但正如您将在下面看到的那样，图表周围有很多空间。

在这里查看我的示例代码:

---
title: "Untitled"
author: "test"
date: "14/05/2020"
output: pdf_document
---

# My Markdown-file
This is my RMarkdown-file. Now I want to add a flowchart using the packages DiagrammeR. 

```{r figure_1, echo = FALSE, fig.align='center', fig.cap = "Flowchart 1: Some explanation"}

DiagrammeR::grViz(" 
      digraph test {

        node [shape = circle] 
          A; B

        A -> B

      }
        ")

```

I now continue writing.

此代码产生以下输出:



请注意以下事项:

即使我在代码块中指定它是这样，该图也没有居中。

图表和标题之间存在巨大差距。

我该如何解决这些问题？我喜欢这些软件包，但是当输出为 pdf 时可能很难使用？也许其他包更好？

Answer 1

好问题。我玩了一下markdown chunk options并找到以下解决方法来嵌入 png 而不是 pdf 图:

---
title: "Untitled"
author: "test"
date: "14/05/2020"
output: 
  pdf_document: 
    keep_tex: yes
---

# My Markdown-file

This is my RMarkdown-file. Now I want to add a flowchart using the packages DiagrammeR.

```{r echo=FALSE, fig.cap = "Flowchart 1: Some explanation", dev='png'}
library("DiagrammeR")
grViz("
      digraph test {
        node [shape = circle]
        A, B

        A -> B
      }
 ")
```

I now continue writing.

其他设备，如 Cairo_PDF也有效，但没有像预期的那样，只是产生了一个 png。我离开了 keep_tex选项以简化调试。