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尝试在 RStudio 中将 .Rpres 和 .Rmd 文件发布到 RPub 时，我收到了一些不同的错误消息。除了下面两个之外，另一个错误只是一个空白的错误响应。我尝试过在连接到 VPN 时和断开连接时都进行发布，但在我返回的错误类型中找不到模式。
过去(大约一个月前)，我已经能够成功地将 .Rmd 文件发布到 RPubs。当我重新发布 RPub 上存在的那个 .Rmd 时，它被覆盖了，现在是空白的。
不确定这是 openssl 问题还是其他问题。我不认为错误消息曾明确提到 SSL，但以防万一我尝试从自制软件重新安装 openssl，sudo 接受 xcodebuild 许可证和 CRAN；一切看起来都很好(package ‘openssl’ 成功解压并检查了 MD5 总和)。
我还在我的 .RProfile 中添加了 options(rpubs.upload.method = "internal")。
我在 OSX 版本 10.13 上运行 R 版本 3.3.3 和 RStudio 版本 1.1.383。
Error in function (type, msg, asError = TRUE) : Empty reply from server
Calls: <Anonymous> ... tryCatch -> tryCatchList -> tryCatchOne -> <Anonymous>
Execution halted
<!DOCTYPE html>
<html>
<head>
<title>Error</title>
<style>
body {
width: 35em;
margin: 0 auto;
font-family: Tahoma, Verdana, Arial, sans-serif;
}
</style>
</head>
<body>
<h1>An error occurred.</h1>
<p>Sorry, the page you are looking for is currently unavailable.<br/>
Please try again later.</p>
<p>If you are the system administrator of this resource then you should check
the <a href="http://nginx.org/r/error_log">error log</a> for details.</p>
<p><em>Faithfully yours, nginx.</em></p>
</body>
</html>
编辑:options(RCurlOptions = list(verbose = TRUE, capath = system.file("CurlSSL", "cacert.pem", package = "RCurl") 时的完整响应, ssl.verifypeer = TRUE)) 添加到 Rprofile`
* Trying 50.19.223.253...
* TCP_NODELAY set
* Connected to api.rpubs.com (50.19.223.253) port 443 (#0)
* ALPN, offering http/1.1
* Cipher selection: ALL:!EXPORT:!EXPORT40:!EXPORT56:!aNULL:!LOW:!RC4:@STRENGTH
* successfully set certificate verify locations:
* CAfile: /Users/amanda/Library/R/3.3/library/rsconnect/cert/cacert.pem
CApath: /Users/amanda/Library/R/3.3/library/RCurl/CurlSSL/cacert.pem
* SSL connection using TLSv1.2 / ECDHE-RSA-AES128-GCM-SHA256
* ALPN, server did not agree to a protocol
* Server certificate:
* subject: CN=rpubs.com
* start date: Oct 30 00:00:00 2017 GMT
* expire date: Nov 30 12:00:00 2018 GMT
* subjectAltName: host "api.rpubs.com" matched cert's "api.rpubs.com"
* issuer: C=US; O=Amazon; OU=Server CA 1B; CN=Amazon
* SSL certificate verify ok.
> POST /api/v1/document HTTP/1.1
Host: api.rpubs.com
User-Agent: rsconnect/0.8.5
Accept: */*
Connection: close
Content-Type: application/x-compressed
Content-Length: 10630431
Expect: 100-continue
< HTTP/1.1 100 Continue
* We are completely uploaded and fine
* Empty reply from server
* Connection #0 to host api.rpubs.com left intact
Error in function (type, msg, asError = TRUE) : Empty reply from server
Calls: <Anonymous> ... tryCatch -> tryCatchList -> tryCatchOne -> <Anonymous>
Execution halted
最佳答案
我建议您将以下行添加到您的 .RProfile
options(rpubs.upload.method = "internal")
options(RCurlOptions = list(verbose = FALSE, capath = system.file("CurlSSL", "cacert.pem", package = "RCurl"), ssl.verifypeer = TRUE))
(1) 创建一个文本文件并在其中输入以下行:
选项(rpubs.upload.method = “内部”)
(2) 将文件保存在与您的 knitr 项目相同的目录中。文件名应为 .Rprofile(或在您的主目录中)
注意名称以点(.)开头
(3) 现在切换到 knitr 项目目录并编译你的 Rmd 文件。
(4) 打开浏览器，使用用户名和密码登录Rpubs。 (这是可选的，但有时它被认为是必要的步骤)。
(5) 返回 R 工作室，按“发布”。
如果上述方法不起作用，请删除并重新安装 RCurl
remove.packages("RCurl")
install.packages("RCurl")
然后我会重启 RStudio 并尝试通过 RStudio 发布。如果仍然失败，我的建议是删除 RStudio 并重新安装。
为什么？好吧，第二行解决了我在 RPubs 发布方面的问题:-)
要进行调试，您可以设置 verbose = TRUE。
您在 Mac OS X 上使用什么包管理器？
我问这个问题可能与您的软件包安装的潜在问题有关。即，如果您使用的是 brew，那么您可能需要做一个 brew doctor 来检查您的配置。
如果您在代理后面运行，则需要配置访问权限。
如果您仍然遇到问题，我建议您查看:
关于r - 将 RMarkdown 发布到 RPubs 时，nginx 和服务器错误的空回复，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/47058785/
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