Rscript 找不到函数

Question

我需要使用 Rscript 通过 bash shell 运行多个脚本我使用的一些函数需要函数 isGeneric .但是，在这种情况下，过程会像这样结束(例如):

Error in .getLogLik() : could not 
find function "isGeneric"
Calls: main -> dredge -> .getLik -> .getLogLik
Execution halted

这可以重现如下

# in the bash shell
echo "isGeneric('apply')" > /tmp/test.R
Rscript /tmp/test.R

结果:

Error: could not find function "isGeneric"
Execution halted

但是，如果我们打开一个 R session 并键入以下内容，它会起作用:

# in the R shell
isGeneric('apply')
[1] FALSE

你知道问题来自哪里以及如何解决吗？

Answer 1

根据 help(Rscript) , Rscript默认情况下不加载方法包，因为它很耗时。所以你要么需要在命令行上指定它:

Rscript --default-packages=methods file.R

或 library(methods)在您调用的文件的顶部。