r - ggplot2:没有填充的geom_polygon

Question

我希望，你不需要这个问题的数据，因为我相信我只是犯了一个愚蠢的语法错误。以下代码:

ggplot()+
  geom_point(data=sites, aes(x=NMDS1, y=NMDS2, shape=group), colour="grey") +  
  geom_point(data=species, aes(x=NMDS1, y=NMDS2, color=phyla), size=3, shape=20) + scale_colour_manual(values=Pal1) +
  geom_segment(data = BiPlotscores, aes(x = 0, xend = NMDS1, y= 0, yend = NMDS2),
               arrow = arrow(length = unit(0.25, "cm")), colour = "black") +
  geom_text(data = BiPlotscores, aes(x = 1.1*NMDS1, y = 1.1*NMDS2, label = Parameters), size = 3) + coord_fixed()+
  theme(panel.background = element_blank()) +
  geom_polygon(data = hulls, aes(x=NMDS1, y=NMDS2, colour=phyla, alpha = 0.2))

导致以下结果:



(这不是最终产品:))。
我想让多边形不填充，或者非常整齐地填充。当然，我不希望它们变灰。 Fill 没有做任何事情，显然摆弄 alpha 也不会改变任何事情。

任何想法都非常受欢迎。非常感谢你!

“Hulls”来自以下代码(如在某处找到):

#find hulls
library(plyr)
find_hull <- function(df) df[chull(df$NMDS1, df$NMDS2), ]
hulls <- ddply(species , "phyla", find_hull)

Answer 1

如果您想要透明填充，请执行 fill=NA外aes() -规范。

library(ggplot2)
data <- data.frame(y=c(2,2,1), x=c(1,2,1))
ggplot(data) + geom_polygon(aes(x=x, y=y), colour="black", fill=NA)