r - glmmTMB 'giveCsparse' 每种型号中的警告

Question

我正在使用 glmmTMB 库在 R Markdown 文档中运行混合模型。我运行的任何模型，都会收到以下警告:

'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you

然后，如果我在控制台中运行代码，则会收到以下警告:

Warning messages:
1: In Matrix::sparseMatrix(dims = c(0, 0), i = integer(0), j = integer(0),  :
  'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you
2: In Matrix::sparseMatrix(dims = c(0, 0), i = integer(0), j = integer(0),  :
  'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you
3: In Matrix::sparseMatrix(dims = c(0, 0), i = integer(0), j = integer(0),  :
  'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you

我的代码如下所示:

m1 <- glmmTMB(count~var1+var2+var3+(1|group), data = bd, family = "poisson")

我尝试使用 dependencies=TRUE 重新安装 TMB 和 glmmTMB ，但消息不断出现。显然它根本不会影响模型，但是无论我做什么测试或图表，我都会收到警告。有没有可能解决这个问题？或者我只是忽略它？

Answer 1

这是无害的。你可以:

安装最新版glmmTMB (目前为 1.1.2)来自 CRAN。

忽略它

使用 suppressWarnings() (可能会以错过其他相关警告为代价!)

install the development version from GitHub ，它被修复在 this commit . (存储库中的二进制包现在也已更新。)

或者你可以降级你的版本 Matrix到旧版本(使用 remotes::install_version() 或 snapshot 包)