r - 我无法安装任何 Bioconductor 包 : "Error in readRDS(dest) : error reading from connection"

Question

您好(这是我的第一条消息，所以如果有什么不对的地方，我很抱歉)，
我已经有这个问题几天了。我无法安装新的软件包，我读过类似的 question但就我而言，只有当我尝试安装新的 时才会出现问题。生物导体 包(或者当我删除旧的并尝试重新安装它时)。
问题是我总是得到下一条消息的一些变化(在这个例子中我试图安装 ComplexHeatmap):

BiocManager::install("ComplexHeatmap")

Bioconductor version 3.12 (BiocManager 1.30.13), R 4.0.0 (2020-04-24)Installing package(s) 'BiocVersion', 'ComplexHeatmap' also installingthe dependencies �shape�, �rjson�, �BiocGenerics�, �circlize�,�GetoptLong�, �colorspace�, �clue�, �RColorBrewer�, �GlobalOptions�,�png�, �Cairo�, �S4Vectors�, �IRanges�, �matrixStats�

cannot open URL
'https://bioconductor.org/packages/3.12/data/annotation/bin/windows/contrib/4.0/PACKAGES.rds':HTTP status was '404 Not Found'Old packages: 'installr', 'boot','class', 'cluster', 'codetools', 'foreign', 'KernSmooth', 'lattice','MASS', 'Matrix', 'mgcv', 'nlme', 'nnet', 'spatial', 'survival' Updateall/some/none? [a/s/n]: Update all/some/none? [a/s/n]:

它告诉我我必须安装 X 包，所以我输入“a”，然后发生了这种情况:

Error in readRDS(dest) : error reading from connection

第一次尝试后，我只收到第二条消息，直到我重新启动 R。
我试过了:

开始 Rscripts(或 Rmarkdowns)的新 session

删除所有包(直接删除文件夹)

卸载并重新安装 R 和 RStudio(尝试不同版本，R 降至 4.0)

重启 R 和计算机

我尝试安装以前版本的 BiocManager，但无法安装。
一切都在更新。
非常感谢您的关注，感谢您的帮助。

Answer 1

这是 a known issue with BiocManager 1.30.13 .通过运行以下命令安装开发版本:

install.packages("devtools")    
devtools::install_github("Bioconductor/BiocManager", ref="ghost-binary-repo")