r - 如何在 R 中的系统命令中运行 "conda ***"

Question

我想在 conda 环境中运行系统命令，但我不知道如何让 R 将命令发送到正确初始化的 bash shell。我试过 system('conda activate myenv && mycommand') ，但我收到警告，需要运行 conda init bash .正在尝试 system('conda init bash && conda activate myenv')抛出同样的错误。制作 bash第一个命令卡住 RStudio，例如system('bash && .... )`。

有什么方法可以在 R 中发送一个系统命令，该命令会在获取我的 .bashrc 文件后运行？

Answer 1

使用 conda 运行。

system('conda run -n myenv mycommand')

见 conda run --help详情。