R 如何获得多项 logit 的置信区间？

Question

让我使用 UCLA 的多项 logit 示例作为运行示例---

library(nnet)
library(foreign)

ml <- read.dta("http://www.ats.ucla.edu/stat/data/hsbdemo.dta")
ml$prog2 <- relevel(ml$prog, ref = "academic")
test <- multinom(prog2 ~ ses + write, data = ml)

dses <- data.frame(ses = c("low", "middle", "high"), write = mean(ml$write))
predict(test, newdata = dses, "probs")

我想知道如何获得 95% 的置信区间？

Answer 1

这可以通过 effects 来完成。包，我在交叉验证 here 上为另一个问题展示了它.

让我们看看你的例子。

library(nnet)
library(foreign)

ml <- read.dta("http://www.ats.ucla.edu/stat/data/hsbdemo.dta")
ml$prog2 <- relevel(ml$prog, ref = "academic")
test <- multinom(prog2 ~ ses + write, data = ml)

而不是使用 predict()来自 base ，我们使用 Effect()来自 effects

require(effects)

fit.eff <- Effect("ses", test, given.values = c("write" = mean(ml$write)))

data.frame(fit.eff$prob, fit.eff$lower.prob, fit.eff$upper.prob)

  prob.academic prob.general prob.vocation L.prob.academic L.prob.general L.prob.vocation U.prob.academic
1     0.4396845    0.3581917     0.2021238       0.2967292     0.23102295      0.10891758       0.5933996
2     0.4777488    0.2283353     0.2939159       0.3721163     0.15192359      0.20553211       0.5854098
3     0.7009007    0.1784939     0.1206054       0.5576661     0.09543391      0.05495437       0.8132831
  U.prob.general U.prob.vocation
1      0.5090244       0.3442749
2      0.3283014       0.4011175
3      0.3091388       0.2444031

如果我们愿意，我们还可以使用 effects 中的工具绘制预测概率及其各自的置信区间。 .

plot(fit.eff)