r - Knit & rmarkdown::render() 产生不同的结果(kable 格式；PDF)

Question

我有一些 Rmarkdown 文档，我正在尝试使用 knit/render如 PDF 文件。我要获取render正常工作，因为我将在具有多个 Rmd 文件以及许多其他进程(例如数据抓取和处理)的脚本中运行它。
使用 knit按钮产生所需的结果。如果我使用 rmarkdown::render表格布局变得古怪(见示例)。这是一个重现我的问题的最小示例。
RMD

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title: "RmdTest"
author: "TTS"
date: '`r format(Sys.time(), "%d %B, %Y")`'
output: pdf_document
always_allow_html: true
---

```{r Rmd-Setup, include=FALSE}
options(knitr.kable.NA = '')

library(kableExtra)

# Dummy Data
df <- structure(list(Location = c("Farm", "Farm", "Farm", "Farm"), 
    Animal = c("dog", "cat", "cat", "cat"), Age = c("Adult", 
    "Juvenile", "Adult", "Total"), Abundance = c(27269L, 62308L, 
    34904L, 97212L)), row.names = c(NA, -4L), class = "data.frame")
```


## Why?

The 'Knit' button is producing the desired result, while running rmarkdown::render is producing a different (undesirable) result.

```{r Table-1, echo=FALSE}
kable(df, caption = 'This data does not make sense.', booktabs = TRUE) %>%
  kable_styling(latex_options = 'scale_down') %>%
  landscape() %>%
  add_footnote(label = 'Here is a footnote.') 
```

渲染

  rmarkdown::render(input = 'test.Rmd', output_format = "pdf_document")

版本

R version 4.0.0 (2020-04-24)
Rmarkdown v 1.1
kableExtra v 1.1.0

预期结果:获取 render具有与 knit 相同的输出按钮，特别是表格格式。任何帮助表示赞赏。如果任何其他信息有帮助，请告诉我。干杯!
截图


新的奇怪行为
通过退出并重新启动 RStudio 重新启动 R session 后，我可以运行 render成功，具有所需的格式。试图运行 render再次返回错误消息后立即再次: ! LaTeX Error: Environment landscape undefined.但是，如果我使用 .rs.restartR() , render产生不正确的格式。运行 render之后产生相同的结果:产生格式不正确的 PDF。
注:我今天早上重新安装了 tinytex 以确保这不是问题。

Answer 1

尝试在 YAML 序言中包含正确的 Latex 包。我不知道为什么在 Rstudio UI 中选择 Knit 按钮并使用 render功能不同；但他们这样做。我发现包括 Latex 包通常可以解决问题。

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title: "RmdTest"
author: "TTS"
date: '`r format(Sys.time(), "%d %B, %Y")`'
header-includes:
- \usepackage{pdflscape}
- \usepackage{booktabs}
output: pdf_document
always_allow_html: true
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