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我一直在阅读 vignette on extending ggplot2 ,但我对如何制作可以向绘图添加多个几何图形的单个几何图形有些困惑。 ggplot2 geoms 中已经存在多个几何图形,例如,我们有类似 geom_contour
的东西。 (多条路径)和 geom_boxplot
(多个路径和点)。但我不太明白如何将它们扩展到新的几何体中。
假设我正在尝试制作 geom_manythings
这将通过在单个数据集上计算来绘制两个多边形和一个点。一个多边形将是所有点的凸包,第二个多边形将是点子集的凸包,单个点将代表数据的中心。我希望所有这些都通过对一个 geom 的调用出现,而不是三个单独的调用,正如我们在这里看到的:
# example data set
set.seed(9)
n <- 1000
x <- data.frame(x = rnorm(n),
y = rnorm(n))
# computations for the geometries
# chull for all the points
hull <- x[chull(x),]
# chull for all a subset of the points
subset_of_x <- x[x$x > 0 & x$y > 0 , ]
hull_of_subset <- subset_of_x[chull(subset_of_x), ]
# a point in the centre of the data
centre_point <- data.frame(x = mean(x$x), y = mean(x$y))
# plot
library(ggplot2)
ggplot(x, aes(x, y)) +
geom_point() +
geom_polygon(data = x[chull(x),], alpha = 0.1) +
geom_polygon(data = hull_of_subset, alpha = 0.3) +
geom_point(data = centre_point, colour = "green", size = 3)
geom_manythings
更换三个
geom_*
在上面的代码中。
geom_tufteboxplot
中的代码开始和
geom_boxplot
作为模板,以及“扩展 ggplot2”小插图:
library(ggplot2)
library(proto)
GeomManythings <- ggproto(
"GeomManythings",
GeomPolygon,
setup_data = function(self, data, params) {
data <- ggproto_parent(GeomPolygon, self)$setup_data(data, params)
data
},
draw_group = function(data, panel_scales, coord) {
n <- nrow(data)
if (n <= 2)
return(grid::nullGrob())
common <- data.frame(
colour = data$colour,
size = data$size,
linetype = data$linetype,
fill = alpha(data$fill, data$alpha),
group = data$group,
stringsAsFactors = FALSE
)
# custom bits...
# polygon hull for all points
hull <- data[chull(data), ]
hull_df <- data.frame(x = hull$x,
y = hull$y,
common,
stringsAsFactors = FALSE)
hull_grob <-
GeomPolygon$draw_panel(hull_df, panel_scales, coord)
# polygon hull for subset
subset_of_x <-
data[data$x > 0 & data$y > 0 ,]
hull_of_subset <-
subset_of_x[chull(subset_of_x),]
hull_of_subset_df <- data.frame(x = hull_of_subset$x,
y = hull_of_subset$y,
common,
stringsAsFactors = FALSE)
hull_of_subset_grob <-
GeomPolygon$draw_panel(hull_of_subset_df, panel_scales, coord)
# point for centre point
centre_point <-
data.frame(x = mean(coords$x),
y = coords(data$y),
common,
stringsAsFactors = FALSE)
centre_point_grob <-
GeomPoint$draw_panel(centre_point, panel_scales, coord)
# end of custom bits
ggname("geom_mypolygon",
grobTree(hull_grob,
hull_of_subset_grob,
centre_point_grob))
},
required_aes = c("x", "y"),
draw_key = draw_key_polygon,
default_aes = aes(
colour = "grey20",
fill = "grey20",
size = 0.5,
linetype = 1,
alpha = 1,
)
)
geom_manythings <-
function(mapping = NULL,
data = NULL,
stat = "identity",
position = "identity",
na.rm = FALSE,
show.legend = NA,
inherit.aes = TRUE,
...) {
layer(
geom = GeomManythings,
mapping = mapping,
data = data,
stat = stat,
position = position,
show.legend = show.legend,
inherit.aes = inherit.aes,
params = list(na.rm = na.rm, ...)
)
}
ggplot(x, aes(x, y)) +
geom_point() +
geom_manythings()
最佳答案
你的代码有很多问题,所以我建议你先尝试一个简化的案例。特别是,chull 计算是有问题的。尝试这个,
library(ggplot2)
library(proto)
library(grid)
GeomManythings <- ggproto(
"GeomManythings",
Geom,
setup_data = function(self, data, params) {
data <- ggproto_parent(Geom, self)$setup_data(data, params)
data
},
draw_group = function(data, panel_scales, coord) {
n <- nrow(data)
if (n <= 2)
return(grid::nullGrob())
# polygon hull for all points
hull_df <- data[chull(data[,c("x", "y")]), ]
hull_grob <-
GeomPolygon$draw_panel(hull_df, panel_scales, coord)
# polygon hull for subset
subset_of_x <-
data[data$x > 0 & data$y > 0 ,]
hull_of_subset_df <-subset_of_x[chull(subset_of_x[,c("x", "y")]),]
hull_of_subset_df$fill <- "red" # testing
hull_of_subset_grob <- GeomPolygon$draw_panel(hull_of_subset_df, panel_scales, coord)
coords <- coord$transform(data, panel_scales)
pg <- pointsGrob(x=mean(coords$x), y=mean(coords$y),
default.units = "npc", gp=gpar(col="green", cex=3))
ggplot2:::ggname("geom_mypolygon",
grobTree(hull_grob,
hull_of_subset_grob, pg))
},
required_aes = c("x", "y"),
draw_key = draw_key_polygon,
default_aes = aes(
colour = "grey20",
fill = "grey50",
size = 0.5,
linetype = 1,
alpha = 0.5
)
)
geom_manythings <-
function(mapping = NULL,
data = NULL,
stat = "identity",
position = "identity",
na.rm = FALSE,
show.legend = NA,
inherit.aes = TRUE,
...) {
layer(
geom = GeomManythings,
mapping = mapping,
data = data,
stat = stat,
position = position,
show.legend = show.legend,
inherit.aes = inherit.aes,
params = list(na.rm = na.rm, ...)
)
}
set.seed(9)
n <- 20
d <- data.frame(x = rnorm(n),
y = rnorm(n))
ggplot(d, aes(x, y)) +
geom_manythings()+
geom_point()
关于r - 如何制作具有多个几何图形的自定义 ggplot2 geom,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/36156387/
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