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bioinformatics - 如何使用plink将vcf文件转换为ped文件?

转载 作者:行者123 更新时间:2023-12-03 18:56:51 25 4
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我正在尝试使用 plink 将 .vcf 文件转换为 .ped 文件。我在网上看了一些手册和帖子,但似乎没有人特别提到如何将vcf转换为ped。

我希望这里可能有一些专家,他们有使用plink将vcf转换为ped的经验。如果您能分享知识,我将不胜感激。此外,如果有另一种方式(非链接)这样做,请分享。

谢谢!

最佳答案

Plink 提供了自己的功能,用于将 vcf(和其他格式)文件转换为与 plink 兼容的文件。您要查找的命令是 recode实际命令如下所示:

plink --vcf myfile.vcf.gz --recode --out myfile

关于bioinformatics - 如何使用plink将vcf文件转换为ped文件?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/39671015/

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