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我正在尝试使用 plink 将 .vcf 文件转换为 .ped 文件。我在网上看了一些手册和帖子,但似乎没有人特别提到如何将vcf转换为ped。
我希望这里可能有一些专家,他们有使用plink将vcf转换为ped的经验。如果您能分享知识,我将不胜感激。此外,如果有另一种方式(非链接)这样做,请分享。
谢谢!
最佳答案
Plink 提供了自己的功能,用于将 vcf(和其他格式)文件转换为与 plink 兼容的文件。您要查找的命令是 recode实际命令如下所示:
plink --vcf myfile.vcf.gz --recode --out myfile
关于bioinformatics - 如何使用plink将vcf文件转换为ped文件?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/39671015/
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plink user@10.220.60.xx -t '/home/user/test/testpgm' 我能够使用上面的 plink cmd 从 Windows 机器运行驻留在 Linux 机器上的
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我是一名优秀的程序员,十分优秀!