r - ggplot2 的功能强化错误

Question

我正在尝试使用 ggplot2 包中的 fortify 函数将空间对象转换为 data.frame。但我收到一个错误。例如，遵循 Hadley Wickhan's plotting polygon shapefiles example 中使用的完全相同的代码，我输入以下命令行:

 require("rgdal") 
 require("maptools")
 require("ggplot2")
 require("plyr")
 utah = readOGR(dsn="/path/to/shapefile", layer="eco_l3_ut")
   OGR data source with driver: ESRI Shapefile 
   Source: ".", layer: "eco_l3_ut"
   with 10 features and 7 fields
   Feature type: wkbPolygon with 2 dimensions
 utah@data$id = rownames(utah@data)

一切似乎都正常:

 > str(utah)
      ..@ data       :'data.frame': 10 obs. of  8 variables:
      .. ..$ AREA      : num [1:10] 1.42e+11 1.33e+11 3.10e+11 4.47e+10 1.26e+11 ...
      .. ..$ PERIMETER : num [1:10] 4211300 3689180 4412500 2722190 3388270 ...
      .. ..$ USECO_    : int [1:10] 164 170 204 208 247 367 373 386 409 411
      .. ..$ USECO_ID  : int [1:10] 163 216 201 206 245 366 372 385 408 410
      .. ..$ ECO       : Factor w/ 7 levels "13","14","18",..: 7 3 1 4 5 6 2 4 4 6
      .. ..$ LEVEL3    : int [1:10] 80 18 13 19 20 21 14 19 19 21
      .. ..$ LEVEL3_NAM: Factor w/ 7 levels "Central Basin and Range",..: 4 7 1 6 2 5 3 6 6 5
      .. ..$ id        : chr [1:10] "0" "1" "2" "3" ...
      ...
      ...

但是，当我尝试使用 packcage ggplot2 中的 fortify 函数转换 utah 对象时，出现以下错误:

 > utah.points = fortify(utah, region="id")
  Error in UseMethod("fortify") : no applicable method for 'fortify' applied to an object of class "c('SpatialPolygonsDataFrame', 'SpatialPolygons', 'Spatial')"

对于我尝试使用 fortify 转换的所有其他空间对象，我遇到了相同的错误；即使使用过去运行良好的代码(在升级到 R 的 3.0.2 版之前)。

我在配备 Intel Core i7 和 16GB 内存的 Mac 上运行 R 版本 3.0.2。

Answer 1

我遇到了同样的问题。
重新安装主要软件包后，错误消息仍然存在。

最终我意识到一个函数 fortify也存在于包装中 lme4在 ggplot2 之后加载的.
使用 ggplot2::fortify(utah, region="id")解决了这个问题。