r - 无法安装 'RCurl' (Rcurl.h :4:23: fatal error: curl/curl. h: No such file or directory)

Question

我尝试了多种方法来安装 RCurl，但无济于事。我在我的输出中得到了这个:

    * installing *source* package 'RCurl' ...
** package 'RCurl' successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
C:/Users/XXX/Documents/R/Rtools/mingw_64/bin/gcc  -I"C:/PROGRA~1/R/R-33~1.1/include" -DNDEBUG -I/include -DHAVE_LIBIDN_FIELD=1 -DHAVE_CURLOPT_URL=1 -DHAVE_CURLINFO_EFFECTIVE_URL=1 -DHAVE_CURLINFO_RESPONSE_CODE=1 -DHAVE_CURLINFO_TOTAL_TIME=1 -DHAVE_CURLINFO_NAMELOOKUP_TIME=1 -DHAVE_CURLINFO_CONNECT_TIME=1 -DHAVE_CURLINFO_PRETRANSFER_TIME=1 -DHAVE_CURLINFO_SIZE_UPLOAD=1 -DHAVE_CURLINFO_SIZE_DOWNLOAD=1 -DHAVE_CURLINFO_SPEED_DOWNLOAD=1 -DHAVE_CURLINFO_SPEED_UPLOAD=1 -DHAVE_CURLINFO_HEADER_SIZE=1 -DHAVE_CURLINFO_REQUEST_SIZE=1 -DHAVE_CURLINFO_SSL_VERIFYRESULT=1 -DHAVE_CURLINFO_FILETIME=1 -DHAVE_CURLINFO_CONTENT_LENGTH_DOWNLOAD=1 -DHAVE_CURLINFO_CONTENT_LENGTH_UPLOAD=1 -DHAVE_CURLINFO_STARTTRANSFER_TIME=1 -DHAVE_CURLINFO_CONTENT_TYPE=1 -DHAVE_CURLINFO_REDIRECT_TIME=1 -DHAVE_CURLINFO_REDIRECT_COUNT=1 -DHAVE_CURLINFO_PRIVATE=1 -DHAVE_CURLINFO_HTTP_CONNECTCODE=1 -DHAVE_CURLINFO_HTTPAUTH_AVAIL=1 -DHAVE_CURLINFO_PROXYAUTH_AVAIL=1 -DHAVE_CURLINFO_OS_ERRNO=1 -DHAVE_CURLINFO_NUM_CONNECTS=1 -DHAVE_CURLINFO_SSL_ENGINES=1 -DHAVE_CURLINFO_COOKIELIST=1 -DHAVE_CURLINFO_LASTSOCKET=1 -DHAVE_CURLINFO_FTP_ENTRY_PATH=1 -DHAVE_CURLINFO_REDIRECT_URL=1 -DHAVE_CURLINFO_PRIMARY_IP=1 -DHAVE_CURLINFO_APPCONNECT_TIME=1 -DHAVE_CURLINFO_CERTINFO=1 -DHAVE_CURLINFO_CONDITION_UNMET=1 -DHAVE_CURLOPT_KEYPASSWD=1 -DHAVE_CURLOPT_DIRLISTONLY=1 -DHAVE_CURLOPT_APPEND=1 -DHAVE_CURLOPT_KRBLEVEL=1 -DHAVE_CURLOPT_USE_SSL=1 -DHAVE_CURLOPT_TIMEOUT_MS=1 -DHAVE_CURLOPT_CONNECTTIMEOUT_MS=1 -DHAVE_CURLOPT_HTTP_TRANSFER_DECODING=1 -DHAVE_CURLOPT_HTTP_CONTENT_DECODING=1 -DHAVE_CURLOPT_NEW_FILE_PERMS=1 -DHAVE_CURLOPT_NEW_DIRECTORY_PERMS=1 -DHAVE_CURLOPT_POSTREDIR=1 -DHAVE_CURLOPT_OPENSOCKETFUNCTION=1 -DHAVE_CURLOPT_OPENSOCKETDATA=1 -DHAVE_CURLOPT_COPYPOSTFIELDS=1 -DHAVE_CURLOPT_PROXY_TRANSFER_MODE=1 -DHAVE_CURLOPT_SEEKFUNCTION=1 -DHAVE_CURLOPT_SEEKDATA=1 -DHAVE_CURLOPT_CRLFILE=1 -DHAVE_CURLOPT_ISSUERCERT=1 -DHAVE_CURLOPT_ADDRESS_SCOPE=1 -DHAVE_CURLOPT_CERTINFO=1 -DHAVE_CURLOPT_USERNAME=1 -DHAVE_CURLOPT_PASSWORD=1 -DHAVE_CURLOPT_PROXYUSERNAME=1 -DHAVE_CURLOPT_PROXYPASSWORD=1 -DHAVE_CURLOPT_SSH_HOST_PUBLIC_KEY_MD5=1 -DHAVE_CURLOPT_NOPROXY=1 -DHAVE_CURLOPT_TFTP_BLKSIZE=1 -DHAVE_CURLOPT_SOCKS5_GSSAPI_SERVICE=1 -DHAVE_CURLOPT_SOCKS5_GSSAPI_NEC=1 -DHAVE_CURLOPT_PROTOCOLS=1 -DHAVE_CURLOPT_REDIR_PROTOCOLS=1 -DHAVE_CURLOPT_SSH_AUTH_TYPES=1 -DHAVE_CURLOPT_SSH_PUBLIC_KEYFILE=1 -DHAVE_CURLOPT_SSH_PRIVATE_KEYFILE=1 -DHAVE_CURLOPT_FTP_SSL_CCC=1 -DHAVE_CURLOPT_COOKIELIST=1 -DHAVE_CURLOPT_IGNORE_CONTENT_LENGTH=1 -DHAVE_CURLOPT_FTP_SKIP_PASV_IP=1 -DHAVE_CURLOPT_FTP_FILEMETHOD=1 -DHAVE_CURLOPT_LOCALPORT=1 -DHAVE_CURLOPT_LOCALPORTRANGE=1 -DHAVE_CURLOPT_CONNECT_ONLY=1 -DHAVE_CURLOPT_CONV_FROM_NETWORK_FUNCTION=1 -DHAVE_CURLOPT_CONV_TO_NETWORK_FUNCTION=1 -DHAVE_CURLOPT_CONV_FROM_UTF8_FUNCTION=1 -DHAVE_CURLOPT_MAX_SEND_SPEED_LARGE=1 -DHAVE_CURLOPT_MAX_RECV_SPEED_LARGE=1 -DHAVE_CURLOPT_FTP_ALTERNATIVE_TO_USER=1 -DHAVE_CURLOPT_SOCKOPTFUNCTION=1 -DHAVE_CURLOPT_SOCKOPTDATA=1 -DHAVE_CURLOPT_SSL_SESSIONID_CACHE=1 -DHAVE_CURLOPT_WRITEDATA=1 -DCURL_STATICLIB    -I"d:/Compiler/gcc-4.9.3/local330/include"     -O2 -Wall  -std=gnu99 -mtune=core2 -c base64.c -o base64.o
In file included from base64.c:1:0:
Rcurl.h:4:23: fatal error: curl/curl.h: No such file or directory
 #include <curl/curl.h>
                       ^
compilation terminated.
make: *** [base64.o] Error 1
Warning: running command 'make -f "Makevars.win" -f "C:/PROGRA~1/R/R-33~1.1/etc/x64/Makeconf" -f "C:/PROGRA~1/R/R-33~1.1/share/make/winshlib.mk" SHLIB="RCurl.dll" WIN=64 TCLBIN=64 OBJECTS="base64.o curl.o curlInit.o curl_base64.o enums.o json.o memoryManagement.o myUTF8.o"' had status 2
ERROR: compilation failed for package 'RCurl'
* removing 'C:/Users/XXX/Documents/R/win-library/3.3/RCurl'
Warning in install.packages :
  running command '"C:/PROGRA~1/R/R-33~1.1/bin/x64/R" CMD INSTALL -l "C:\Users\XXX\Documents\R\win-library\3.3" C:\Users\XXX\AppData\Local\Temp\RtmpKOtnyD/downloaded_packages/RCurl_1.95-4.8.tar.gz' had status 1
Warning in install.packages :
  installation of package ‘RCurl’ had non-zero exit status

我已在 Windows 10 中成功安装 curl(C:curl 中的“curl_X64_ssl”版本)并使其运行。我还在 R 中安装了“curl”包，没有问题。我尝试将这个“curl.h”文件手动添加到 windows 和 R 目录，但它没有解决问题。
还有其他选择吗？

Answer 1

由于 OP 未提供 Bioconductor 解决方案脚本，因此以下对我有用:

## First install BiocManager pkg 
install.packages("BiocManager")
## Use install function from said pkg
BiocManager::install()
## You'll get prompt in console roughly like 
## "Old packages: 'RCurl'
##  Update all/some/none? [a/s/n]:" - type 'a'
a
## hope this works