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我有一个程序运行速度比我希望的要慢。
我做了一些分析,发现了占用绝大多数处理时间的部分
DO K = 0, K_MAX
WRITE(EIGENVALUES_IO, *) K * 0.001 * PI, (W_UP(J), J=1, ATOM_COUNT)
DCMPLXW_UP(:) = DCMPLX(W_UP(:))
DO E = 1, ENERGY_STEPS
ENERGY = MIN_ENERGY + ENERGY_STEP * REAL(E, DP)
ZV = DCMPLX(ENERGY, DELTA)
ON_SITE_SINGLE = DCMPLX(0.0_DP)
DO Q = 1, ATOM_COUNT
DO J = 1, ATOM_COUNT
ON_SITE_SINGLE(J) = ON_SITE_SINGLE(J) + (MATRIX_UP(J, Q) * MATRIX_UP_CONJG(J, Q)) / (ZV - DCMPLXW_UP(Q))
END DO
END DO
DOS_DOWN(E) = DOS_DOWN(E) - WEIGHTS(K) * SUM(IMAG(ON_SITE_SINGLE))
END DO
END DO
线
ON_SITE_SINGLE(J) = ON_SITE_SINGLE(J) + (MATRIX_UP(J, Q) * MATRIX_UP_CONJG(J, Q)) / (ZV - DCMPLXW_UP(Q))
是造成损害的那个。
我在这方面相当新手,有什么方法可以加快速度吗? AFAIK,同样的原则也适用于 C,所以你们的任何帮助也将是很好的。
数组都很复杂
K_MAX 为 1000
ENERGY_STEPS 是 1000
ATOM_COUNT 很低(< 50)
最佳答案
我所有的程序运行速度都比我希望的要慢。在我的所有(好吧,不是全部,但很多)我的科学程序中都有一个深循环嵌套,其中最内层的语句占用了大部分计算时间。通常我希望这些语句占用我 90% 以上的计算。您最里面的语句被执行了 2.5x10^9 次,因此您应该预计它会占用总时间的很大一部分。
考虑到这一点,我建议您:
a) 听取@Alexandre 的建议,使用 BLAS 而不是自制的矩阵 vector 乘法。
b) 忽略@Yuval 关于将操作提升到循环之外的建议——如果你将优化调高,一个好的 Fortran 编译器会为你做这件事(警告:这是一个 self 实现的预言,就好像编译器没有'这不是一个好人)。这些天我期望从一个好的 Fortran 中获得很多其他优化,请参见 (d)。 (我不期望编译器优化内存访问,我期望 BLAS。)
c) 对您应该能够从您的程序中获得多少性能形成一个现实的期望。如果您获得的持续 FLOPs 率超过 CPU 额定性能的 10%,那么您就做得很好,您应该花时间做其他事情而不是优化。
d) 仔细阅读编译器文档。确保您了解优化标志的实际作用。确保您正在为正在使用的 CPU 生成代码,而不是为某些较旧的变体生成代码。如果可用,切换到快速 vector 运算。诸如此类。
e) 开始并行化。 OpenMP 是一个很好的起点,正如@Nicolas 指出的那样,一开始学习曲线非常平缓。
哦,您似乎已经遵循的建议 0 是衡量代码的性能并衡量您所做的任何更改的影响。
关于这个可以优化吗?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/3717195/
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