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我有一个用 Julia 编写的非常简单的函数,需要运行数百万次。
代码:
function randfunc()
#rands could be a global variable if desired
rands = rand(200,100000)
for i=1:100000
#the alphabet can continue (and in Q1 as well)
# rand(1:100000) generates a random number within the number of columns in rands
a = rand(1:100000)
b = rand(1:100000)
c = rand(1:100000)
d = rand(1:100000)
e = rand(1:100000)
Q1 = hcat(rands[:,a],rands[:,b],rands[:,c],rands[:,d],rands[:,e])
Q2 = *(Q1.',Q1)
end
end
有什么方法可以加快 hcat 函数的速度或用更高效的东西代替它吗?
加速此函数的另一种方法是手动执行矩阵乘法而不构造 Q1 矩阵,但内置的 *(,)
运算符比使用 +< 运行得更快
和 *
,至少在我的尝试中,这样做似乎比简单地构建 Q1 有更多的开销。
使用 rands = convert(Array{Float32}, rands)
有点帮助,但 Float16
实际上更糟(尤其是对于矩阵乘法)。 rands
中的元素不能是严格的整数,Q1中列向量的个数是任意的。
编辑:这个问题的最初概念是尝试获得一种从数据中调用矩阵的快速方法,这些数据稍后将成为矩阵乘法及其转置的一部分。我已经编辑了代码以尝试解决任何歧义。
旧代码:
function randfunc()
#rands could be a global variable if desired
rands = rand(200,100000)
for i=1:100000-1
Q1 = hcat(rands[:,[i]],rands[:,[i]].*rands[:,[i+1]])
Q2 = *(Q1.',Q1)
end
end
最佳答案
此代码试图通过将计算简化为两个嵌套的 for
循环来优化函数。基本上,这通过根据输入 rands
矩阵元素扩展表达式来计算与原始矩阵形式相同的表达式。返回值是 Q2
矩阵行列式的向量。
function randfunc2(rands)
a,b,c = 0.0,0.0,0.0
detvec = Vector{Float64}(size(rands,2)-1)
@inbounds for i=1:(size(rands,2)-1)
a,b,c = 0.0,0.0,0.0
@inbounds for j=1:size(rands,1)
s = rands[j,i]
t = s*s
u = s*rands[j,i+1]
a += t
b += s*u
c += u*u
end
detvec[i] = a*c-b*b # calc determinant using 2x2 det formula
# Q2 = [a b; b c]
end
return detvec
end
要使用此功能,如问题中的示例所示:
rands = rand(200,100000)
randfunc2(rands) # this returns the determinant vectors.
分配非常少,每个矩阵元素被访问两次但按列顺序(这是快速顺序)。
关于optimization - 优化 Julia 中的连接,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/40429727/
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