r - igraph 固定节点坐标布局

Question

我找到了这个 answer真的很有用。它帮助我绘制网络/图形并选择图中节点的坐标。

但是，布局将坐标重新缩放为 -1 到 1。首先，我试图找出它是如何做到的，但没有。它会做这样的事情吗？？

(coordinate - mean(coordinates))/(coordinate + mean(coordinates)

其次有没有办法保持原始坐标？我想将坐标轴与图形放在一起，因此不希望顶部重新缩放所有内容。

Answer 1

您的第一个问题的答案在 plot.igraph 的源代码中。功能;类型 plot.igraph在 R 提示符下获取完整的源代码。里面有一段说:

layout <- layout.norm(layout, -1, 1, -1, 1)

layout.norm是 igraph的另一个功能这对你有魔力；类型 layout.norm看看它是如何工作的。

现在，第二个问题的答案非常简单；刚通过 rescale=F到 plot 的参数，这使得 igraph跳过 plot.igraph 中的整个分支哪里 layout.norm被调用，因此它将与您的原始坐标一起使用。然后您可以使用 xlim和 ylim像往常一样设置 X 和 Y 轴的限制。