python - 如何在 AllenNLP 中加载微调的 sciBERT 模型？

Question

我已经在 SciIE 数据集上微调了 SciBERT 模型。存储库使用 AllenNLP 来微调模型。训练执行如下:

python -m allennlp.run train $CONFIG_FILE  --include-package scibert -s "$@" 

成功训练后，我有一个 model.tar.gz 文件作为输出，其中包含 weights.th、config.json 和词汇文件夹。我试图将它加载到 allenlp 预测器中:

from allennlp.predictors.predictor import Predictor
predictor = Predictor.from_path("model.tar.gz")

但我收到以下错误:

ConfigurationError: bert-pretrained not in acceptable choices fordataset_reader.token_indexers.bert.type: ['single_id', 'characters','elmo_characters', 'spacy', 'pretrained_transformer','pretrained_transformer_mismatched']. You should either use the--include-package flag to make sure the correct module is loaded, or use a fully qualified class name in your config file like {"model":"my_module.models.MyModel"} to have it imported automatically.

我从未与 allenNLP 合作过，所以我不知道该怎么做。
作为引用，这是描述 token 索引器的配置的一部分

"token_indexers": {
            "bert": {
                "type": "bert-pretrained",
                "do_lowercase": "false",
                "pretrained_model": "/home/tomaz/neo4j/scibert/model/vocab.txt",
                "use_starting_offsets": true
            }
        }

我正在使用 allenlp 版本
名称: allennlp
版本:1.2.1
编辑:
我想我已经取得了很大的进步，我必须使用用于训练模型的相同版本，并且我可以像这样导入模块:

from allennlp.predictors.predictor import Predictor
from scibert.models.bert_crf_tagger import *
from scibert.models.bert_text_classifier import *
from scibert.models.dummy_seq2seq import *
from scibert.dataset_readers.classification_dataset_reader import *

predictor = Predictor.from_path("scibert_ner/model.tar.gz")
dataset_reader="classification_dataset_reader")
predictor.predict(
  sentence="Did Uriah honestly think he could beat The Legend of Zelda in under three hours?"
)

现在我得到一个错误:

No default predictor for model type bert_crf_tagger.\nPlease specify apredictor explicitly

我知道我可以使用 predictor_name明确指定一个预测器，但我不知道选择哪个名称会起作用

Answer 1

我见过很多人有这个问题。在浏览存储库代码后，我发现这是运行预测的最简单方法:

python -m allennlp.run predict /path/to/saved_model/model.tar.gz /path/to/test.txt\
  --include-package scibert --use-dataset-reader\
  --output-file /path/to/where/you/want/predict.txt\
  --predictor  sentence-tagger --batch-size 16

我添加了什么？预测器 sentence-tagger .浏览存储库后，您会发现注册的预测器是 sentence-tagger .虽然 DEFAUL_DICT的标记器包含 sentence_tagger .很多困惑，对吧？告诉我!
这个答案也使您免于编写 predictor .