perl - 使用 inline::C 来加速数学是否值得

Question

我一直在研究处理大量 dna 的 perl 程序。它输出的正是我需要的，但是它比我想要使用 NYTprof 花费的时间要长得多，我已经缩小了主要问题领域，成为将我的值加在一起的循环。使用 inline::C 进行数学运算会使我的程序更快还是我应该接受速度并继续前进？还有其他方法可以提高速度吗？ here是我的程序和它会运行的输入以及已输入默认值的可执行文件。

Answer 1

您不太可能在这里得到有用的帮助(包括在内)。我可以看到您的代码存在各种问题，与语言选择无关。

使用 CPAN。如果您正在解析 genbank，请使用一些 an appropriate module .

你正在用 Perl 编写程序集，Perl 和你都不擅长。当您不将参数传递给子程序，而是到处依赖全局变量时，几乎不可能知道发生了什么。做什么@X1, @X2, @Y1, @Y2意思？

以下可能是您的问题:until ($ender - $starter > $tlength) { (第 153 行)。根据您的测试用例，这些从 103、1 和 200 开始，并且不清楚它们何时或是否发生变化。取决于 @te 中的内容，它可能会也可能不会跳出循环；我只是无法从您的代码中看出。

如果我们确切地知道 add 的参数是什么，那将会有所帮助。 ，输入输出不变量，以及它返回的内容。

这就是我得到的。