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我有一组微阵列数据,我想根据附图(用PowerPoint完成)来表示它。我已经尝试了 R 可用的各种软件包(VennDiagram、venneuler、limma)。但是,我无法按比例绘制数据或显示值。
有谁知道该怎么做?
可以在下面找到要玩的代码!
谢谢!
# you might need these:
source("http://www.bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("limma")
library(VennDiagram)
library(limma)
library(venneuler)
# Trial 1: Kind of proportional but difficult to customize for labels and other stuff
su <- venneuler(c(A=162, B=104, C=86, "A&B"=206, "A&C"=112, "B&C"=90 ,"A&B&C"=2433))
plot(su)
# Trial 2: looks nice but not proportional
hw <- c(F,F,F,F,T,T,T,T)
hm <- c(F,F,T,T,F,F,T,T)
hr <- c(F,T,F,T,F,T,F,T)
c4 <- cbind(hw,hm,hr)
e <- vennCounts(c4)
e[1:8,4] <- c(3193,86,104,90,162,112,206,2433)
vennDiagram(e)
最佳答案
我会推荐包 VennDiagram:
http://cran.r-project.org/web/packages/VennDiagram/VennDiagram.pdf
在第 19 页上,您会找到 10 个非常好的示例(高级和简化示例)。到目前为止,我还没有发现我需要它做的任何事情。
作为对最终在此问题上的其他人的一般帮助(与此问题不直接相关,但相关),我建议您使用 this search 寻找您的答案。
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