r - 可视化R函数依赖关系

Question

对于想可视化软件包依赖关系的人来说，有很多资源，但是我特别感兴趣的是可视化软件包中的函数及其相互依赖。有像miniCRAN这样的工具可以绘制程序包依赖关系，但是在程序包中是否可以绘制函数依赖关系？

例如，假设我的包中只有两个函数。

func1 <- function(n) return(LETTERS[n])
func2 <- function(n) return(func1(n%%26+1))

然后，我只想要一个带有两个标记节点和连接它们的边的图，描述 func2对 func1的依赖性。

我认为有很多软件包确实具有毛茸茸的功能依赖性，这样的实用程序可以帮助理解/组织/重构/等等。

谢谢。

Answer 1

我认为一个更好的选择（建立在mvbutil包的foodweb函数之上）是DependenciesGraph包，它是由datastorm-open在其更通用的visNetwork包之上在Github上构建的。


DependenciesGraph：R包，用于在包和功能之间进行依赖关系可视化


在我的示例中，我一直在可视化自己的软件包以进行维护和开发，并对结果感到非常满意。

library(DependenciesGraph)
library(QualtricsTools) # A package I'm developing
deps <- funDependencies("package:QualtricsTools", "generate_split_coded_comments")
plot(deps)

输出是一个Web服务器（可以在RStudio的查看器中或在单独的浏览器中查看），该服务器使您可以通过下拉菜单或单击它们来选择特定功能，放大和缩小，在周围拖动等等。对我来说，这比使用基数R绘制foodweb函数的输出要好得多，因为通常很难使文本看起来更好地显示在每个节点的顶​​部，在foodweb图中，所有边缘的颜色都有明显的不同，在我看来，基本R绘图功能并不能很好地确保绘图的布局可读或清晰。

与mvbutil的foodweb的比较：

library(mvbutils)
library(QualtricsTools) 
deps <- foodweb(where="package:QualtricsTools", prune='make_split_coded_comments')
plot(deps)

（很抱歉，名称之间存在差异，它们实际上是相同的功能，我只是碰巧在制作这两个图之间重命名了该功能）。