r - R中的平行距离矩阵

Question

目前我正在使用内置函数 dist 来计算 R 中的距离矩阵。

dist(featureVector,method="manhattan")

这是目前应用程序的瓶颈，因此这个想法是并行化这个任务(从概念上来说这应该是可能的)

搜索谷歌和这个论坛没有成功。

有人有想法吗？

Answer 1

R包amap为聚类和主成分分析提供强大的并行化功能。在这些函数中，Dist 方法提供了您所需要的:以并行方式计算并返回距离矩阵。

Dist(x, method = "euclidean", nbproc = 8)

上面的代码用 8 个线程计算欧几里得距离。