r - 渲染多个 Rmarkdown 报告时出现 Pandoc 错误 1033

Question

我有 r包含我调用 rmarkdown::render() 的循环的脚本创建多个 HTML 报告。该过程运行良好，直到我开始生成更大的报告文件(这让我想到了内存问题......)。

几次成功迭代后，该过程停止并在 R 控制台中显示以下消息:Error: pandoc document conversion failed with error 1033 .
render()函数在循环内使用:

for (i in 1:length(random_vector)) {
  id = random_vector[i]

  knitr::knit_meta(class=NULL, clean = TRUE) # does not prevent the problem

  rmarkdown::render("my_rmd_file_that_generates_reports.Rmd", 
                    output_file = paste(id_fiche, "report.html"))

}

这里没有提到这个错误: https://pandoc.org/help.html并且与此不对应: https://github.com/jgm/pandoc/issues/1033 .
这里提到的想法 rmarkdown::render() in a loop - cannot allocate vector of size使用这一行: knitr::knit_meta(class=NULL, clean = TRUE)不是解决这个问题。

注意:我不能给出一个可重复的例子，因为我不知道问题的确切根源，我希望有人遇到同样的问题并找到解决它的方法。

session 信息:

R 版本 3.6.0 (2019-04-26)

平台:x86_64-w64-mingw32/x64(64位)

运行于:Windows 10 x64(内部版本 18362)

[编辑]
这是我正在使用的 pandoc 版本:

>pandoc_version()
[1] ‘2.6’

Answer 1

这是解决错误的过程。这个想法来自@tarleb's评论。
错误 1033 不是 Pandoc 错误；此处未引用:https://github.com/jgm/pandoc/blob/master/MANUAL.txt#L1384 .

而不是用knitr::knit_meta(class=NULL, clean = TRUE)可以解决的内存使用问题

按照建议 here ，更新 Pandoc 可以解决。

使用 rmarkdown::pandoc_version()检查当前用于生成 Rmarkdown 报告的 pandoc 版本。

去这个网站:https://pandoc.org/releases.html并检查您使用的版本是否是最新版本。

对我来说并非如此(我使用的是 Pandoc 的 v2.6，最后一个是 v2.7.3)
所以我遵循了这个页面的教程: https://pandoc.org/installing.html .

然后我检查了是否 rmarkdown::pandoc_version()返回了最新的版本号，然后我重新运行了我的 R 脚本。它解决了这个问题。