conda - 如何识别 conda 包依赖项？

Question

对于给定的 conda包，我如何列出依赖它的包？

我最近在一个已经有 MPI (openmpi) 版本的大学集群上安装了 anaconda。 mpich2包和mpi4py与 anaconda 一起安装的软件包适用于 mpi4py 的演示，但 mpi*编译器(mpicc 等)不兼容。所以我conda remove 'd mpich2和 mpi4py并使用了pip安装mpi4py使用本地 MPI 安装和编译器。

我不得不四处寻找mpi4py的依赖关系，然后是 mpich2的家属，我只确定了mpi4py . 有没有一种“简单”的方法来找出取决于 mpich2 的内容？ ?

Answer 1

mamba repoquery而Mamba主要是 Conda 的直接替代品，它提供的额外功能之一是通过其 repoquery command 进行依赖和反向依赖查询的可靠功能。 .但是请注意，这仅适用于环境级别的关系，因此必须安装包并激活环境。
演示
请注意，这与最初的问题相距多年，所以我只是用 mpi4py 进行演示安装并使用已安装的版本。

$ mamba create -n so-mpi4py mpi4py
## installs 24 packages

$ conda activate so-mpi4py
(so-mpi4py) $ mamba repoquery whoneeds mpich
                  __    __    __    __
                 /  \  /  \  /  \  /  \
                /    \/    \/    \/    \
███████████████/  /██/  /██/  /██/  /████████████████████████
              /  / \   / \   / \   / \  \____
             /  /   \_/   \_/   \_/   \    o \__,
            / _/                       \_____/  `
            |/
        ███╗   ███╗ █████╗ ███╗   ███╗██████╗  █████╗
        ████╗ ████║██╔══██╗████╗ ████║██╔══██╗██╔══██╗
        ██╔████╔██║███████║██╔████╔██║██████╔╝███████║
        ██║╚██╔╝██║██╔══██║██║╚██╔╝██║██╔══██╗██╔══██║
        ██║ ╚═╝ ██║██║  ██║██║ ╚═╝ ██║██████╔╝██║  ██║
        ╚═╝     ╚═╝╚═╝  ╚═╝╚═╝     ╚═╝╚═════╝ ╚═╝  ╚═╝

        mamba (0.19.0) supported by @QuantStack

        GitHub:  https://github.com/mamba-org/mamba
        Twitter: https://twitter.com/QuantStack

█████████████████████████████████████████████████████████████


Executing the query mpich



 Name   Version Build           Depends              Channel           
────────────────────────────────────────────────────────────────────────
 mpi4py 3.1.3   py310hd348148_0 mpich >=3.4,<4.0.0a0 conda-forge/osx-64

就个人而言，我通常使用树格式，与

(so-mpi4py) $ mamba repoquery whoneeds --tree mpich

mpich[3.4.2]
  └─ mpi4py[3.1.3]

真实世界的例子
更多的是对其有用性的证明，我注意到我的一个 R 环境不知何故最终安装了 Python。我对此非常严格，所以我联系了 mamba repoquery whoneeds并发现:

(bioc_3_12) host:dir usr$ mamba repoquery whoneeds -t python

Executing the query python

python[3.9.2]
  ├─ numpy[1.20.2]
  │  └─ colormath[3.0.0]
  │     └─ spectra[0.0.11]
  │        └─ r-rspectra[0.16_0]     # <- this package is the culprit!
  │           └─ r-uwot[0.1.10]
  ├─ networkx[2.5]
  │  └─ colormath already visited
  ├─ certifi[2021.5.30]
  │  └─ setuptools[49.6.0]
  │     ├─ networkx already visited
  │     └─ pip[21.0.1]
  ├─ python_abi[3.9]
  │  ├─ numpy already visited
  │  ├─ certifi already visited
  │  └─ setuptools already visited
  ├─ colormath already visited
  ├─ spectra already visited
  ├─ decorator[4.4.2]
  │  └─ networkx already visited
  ├─ wheel[0.36.2]
  │  └─ pip already visited
  ├─ pip already visited
  └─ setuptools already visited

原来是 r-spectra Conda Forge 中的包装配方有 misstated one of its dependencies成为 Python 包 ( spectra ) 而不是 C++ 动态库 ( spectralib )。