r - 如何将 R 文本+图像输出捕获到一个文件(html、doc、pdf 等)中？

Question

任务是创建一个文件(word、rtf、pdf、html 或其他)，将 R 的输出(例如:不是创建输出的代码)捕获为该格式(包括文本 和 图像)。

这样做的方式应该尽可能少地改变原始 R 脚本。

如果我只关心文本或图像，那么我会使用 ?sink 或 ?pdf。但我不知道如何以简单的方式将两者组合成一个输出。

我知道有一种方法可以 export R output using r2wd ，但它在原始代码中涉及太多的奖章以适应我的口味(我想对于 sweave 解决方案也是如此，尽管我没有经验可言)

以下是 future 示例的示例代码:

START.text.and.image.recording("output.file") # this is the function I am looking for
x <- rnorm(100)
y <- jitter(x)
print(summary(x))
print(head(data.frame(x,y)))
cor(x,y)
plot(x,y)
print(summary(lm(y~x)))
STOP.text.and.image.recording("output.file") # this is the function I am looking for

更新 :我被问到不是 Sweave 或 ReproducibleResearch task view 中的其他选项。

原因是:

我(还)不知道 LaTeX

即使知道 LaTeX，我也想要一些简单的默认值为 的东西，只需 将所有输出按顺序转储。 “简单”意味着 - 尽可能少的额外代码/文件管理开销。

我知道像 sweave 或 brew 这样的东西更具可扩展性，但我想看看是否有针对较小项目/脚本的更“简单”的解决方案。

Answer 1

截至 2012 年 knitr为这个问题提供了完美的解决方案。

例如，创建一个扩展名为 rmd 的文件。将代码包装在几个命令中，如下所示:

```{r}
x <- rnorm(100)
y <- jitter(x)
print(summary(x))
print(head(data.frame(x,y)))
cor(x,y)
plot(x,y)
print(summary(lm(y~x)))
```

您可以通过多种方式将其转换为独立的 HTML 文件。在 RStudio 中，您只需按一个按钮 Knit HTML .
这是 HTML file produced ;要实际查看 HTML 在浏览器中的显示方式，请保存文件并打开它。

如您所料，图像代码和输出交织在一起。

当然，您可以而且通常会将您的文件分成多个 R 代码块。但关键是，你不必这样做。

这是我创建的另外几个示例:

Getting started with R Markdown

Case study in using R Markdown