r - 多线程 Flask 应用程序导致 rpy2 R 进程中的堆栈错误

Question

与此处的错误基本相同，但这些解决方案没有提供足够的信息来复制工作示例:Rpy2 in a Flask App: Fatal error: unable to initialize the JIT
在我的 Flask 应用程序中，使用 rpy2.rinterface 模块，每当我初始化 R 时，我都会收到相同的堆栈使用错误:

import rpy2.rinterface as rinterface 
from rpy2.rinterface_lib import openrlib

with openrlib.rlock: 
    rinterface.initr()

Error: C stack usage 664510795892 is too close to the limit Fatal error: unable to initialize the JIT

rinterface 是 rpy2 中的低级 R 钩子(Hook)，但更高级别的 robjects 模块给出了相同的错误。我尝试将上下文锁和 R 初始化包装在来自多处理模块的 Process 中，但有同样的问题。文档说多线程环境会导致 R 出现问题: https://rpy2.github.io/doc/v3.3.x/html/rinterface.html#multithreading
但是上下文管理器似乎并没有阻止与 R 接口(interface)的问题

Answer 1

rlock是 Python 的 threading.Rlock 的一个实例.它应该处理多线程问题。
但是，如果嵌入式 R 在子进程之间共享，多处理可能会导致类似的问题。此演示脚本的代码显示了 R 和 Python 进程的并行处理说明了这一点:https://github.com/rpy2/rpy2/blob/master/doc/_static/demos/multiproc_lab.py
我认为解决这个问题的方法是配置 Flask，或者很可能是您的 wsgi 层，以创建独立的子进程，或者让您的所有 Flask 进程将 R 计算委托(delegate)给辅助进程(动态创建，或在等待任务执行的进程)。