rust - 如果Rust项目已更新，请重新运行规则

Question

我有一个Snakemake工作流程，其中包含执行一些Rust代码的规则。
我知道要在Rust代码更新时重新运行该规则，我必须指定所有Rust源作为输入。我的目录布局如下:

Snakefile
|- implementation // subfolder containing a Rust workspace.
   |- Cargo.toml
   |- crateA
      |- Cargo.toml
      |- src // directory tree containing *.rs files
   |- crateB
      |- Cargo.toml
      |- src // directory tree containing *.rs files
   |- crateC
      |- Cargo.toml
      |- src // directory tree containing *.rs files

当工作空间中的任何源文件或Cargo.toml更改时，我想重新运行该规则。
有一些标准的方法可以做到吗？
如果不是，我如何自动列出所有Rust 源文件和 Cargo.toml ，作为Snakemake规则的输入？

Answer 1

我猜您可以在列表中收集所有源文件和toml文件，并将该列表传递给需要它的规则。例如。

import pathlib

toml_input = pathlib.Path('implementation').glob('**/*.toml')

rule one:
    input:
        toml_input,
    ...

当然，您要如何收集这些文件……