r - 表中的边际总数

Question

我有一个数据框，其中包含在不同日期从临床分离株中识别出的许多感染。

到目前为止，我已经将数据整理成我想开始使用的形状。我正在尝试为报告的描述性统计准备一系列表。

我一直在使用ftable并获得以下信息:

onset.types <- ftable(SAB$Onset,SAB$MRSA.Type,year(SAB$Collection.Date))
                             2005 2006 2007 2008 2009 2010

Community                     454  472  512  499  525  512
          AUS-2/3-like         28   23   27   29   32   38
          EMRSA-15-like         9    4    4    9    8    8
          nmMRSA               40   47   53   39   64   60
          Other mMRSA           1    3    3   11    5    9
          unclassified MRSA     0    2    0    0    1    1
Hospital                      163  163  156  164  149  165
          AUS-2/3-like         31   33   27   31   29   28
          EMRSA-15-like         3    8    5    9    4    3
          nmMRSA               10    9   13   17   13   12
          Other mMRSA           5    1    6    2    3   10
          unclassified MRSA     2    0    1    0    0    0

两个问题:

1:如何计算边际总计

2:是否有一种简单的方法来计算百分比以及重新计算边际总数

我尝试了Epitools，但没有找到我想要的有用的工具。

非常感谢。

Answer 1

要添加边距，请使用addmargins()

addmargins(table(state.division, state.region))
                    state.region
state.division       Northeast South North Central West Sum
  New England                6     0             0    0   6
  Middle Atlantic            3     0             0    0   3
  South Atlantic             0     8             0    0   8
  East South Central         0     4             0    0   4
  West South Central         0     4             0    0   4
  East North Central         0     0             5    0   5
  West North Central         0     0             7    0   7
  Mountain                   0     0             0    8   8
  Pacific                    0     0             0    5   5
  Sum                        9    16            12   13  50

要计算百分比，请使用 prop.table()

prop.table(table(state.division, state.region))
                    state.region
state.division       Northeast South North Central West
  New England             0.12  0.00          0.00 0.00
  Middle Atlantic         0.06  0.00          0.00 0.00
  South Atlantic          0.00  0.16          0.00 0.00
  East South Central      0.00  0.08          0.00 0.00
  West South Central      0.00  0.08          0.00 0.00
  East North Central      0.00  0.00          0.10 0.00
  West North Central      0.00  0.00          0.14 0.00
  Mountain                0.00  0.00          0.00 0.16
  Pacific                 0.00  0.00          0.00 0.10