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r - 有 pmin 和 pmax 分别取 na.rm,为什么没有 psum?

转载 作者:行者123 更新时间:2023-12-03 10:05:00 25 4
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似乎 R 可能缺少一个明显的简单函数:psum .它是否以不同的名称存在,还是在某个包中?

x = c(1,3,NA,5)
y = c(2,NA,4,1)

min(x,y,na.rm=TRUE) # ok
[1] 1
max(x,y,na.rm=TRUE) # ok
[1] 5
sum(x,y,na.rm=TRUE) # ok
[1] 16

pmin(x,y,na.rm=TRUE) # ok
[1] 1 3 4 1
pmax(x,y,na.rm=TRUE) # ok
[1] 2 3 4 5
psum(x,y,na.rm=TRUE)
[1] 3 3 4 6 # expected result
Error: could not find function "psum" # actual result

我意识到 +已经喜欢 psum ,但是 NA 呢? ?
x+y                      
[1] 3 NA NA 6 # can't supply `na.rm=TRUE` to `+`

有没有案例添加 psum ?或者我错过了什么。

这个问题是这个问题的后续:
Using := in data.table to sum the values of two columns in R, ignoring NAs

最佳答案

继@JoshUlrich 对上一个问题的评论之后,

psum <- function(...,na.rm=FALSE) { 
rowSums(do.call(cbind,list(...)),na.rm=na.rm) }

编辑 :来自斯文·海恩斯坦:
psum2 <- function(...,na.rm=FALSE) { 
dat <- do.call(cbind,list(...))
res <- rowSums(dat, na.rm=na.rm)
idx_na <- !rowSums(!is.na(dat))
res[idx_na] <- NA
res
}

x = c(1,3,NA,5,NA)
y = c(2,NA,4,1,NA)
z = c(1,2,3,4,NA)

psum(x,y,na.rm=TRUE)
## [1] 3 3 4 6 0
psum2(x,y,na.rm=TRUE)
## [1] 3 3 4 6 NA

n = 1e7
x = sample(c(1:10,NA),n,replace=TRUE)
y = sample(c(1:10,NA),n,replace=TRUE)
z = sample(c(1:10,NA),n,replace=TRUE)

library(rbenchmark)
benchmark(psum(x,y,z,na.rm=TRUE),
psum2(x,y,z,na.rm=TRUE),
pmin(x,y,z,na.rm=TRUE),
pmax(x,y,z,na.rm=TRUE), replications=20)

## test replications elapsed relative
## 4 pmax(x, y, z, na.rm = TRUE) 20 26.114 1.019
## 3 pmin(x, y, z, na.rm = TRUE) 20 25.632 1.000
## 2 psum2(x, y, z, na.rm = TRUE) 20 164.476 6.417
## 1 psum(x, y, z, na.rm = TRUE) 20 63.719 2.486

Sven 的版本(可以说是正确的)要慢很多,
尽管它是否重要取决于应用程序。
有人想修改内联/Rcpp 版本吗?

至于为什么它不存在:不知道,但祝你好运让 R-core 做这样的添加......我无法立即想到一个足够普遍的 *misc这可以进入的包......

Matthew 在 r-devel 上的跟进线程在这里(这似乎证实了):
r-devel: There is pmin and pmax each taking na.rm, how about psum?

关于r - 有 pmin 和 pmax 分别取 na.rm,为什么没有 psum?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/13123638/

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