r - 在R中生成调用图

Question

我得到了一大堆格式差的单片R代码，这些代码具有很多功能，并且我想弄清楚什么功能称为什么功能。

我以为我可以使用roxygen的@callGraph东西，但是a)代码必须放在一个包中，这对这段代码来说是一件令人头疼的事情，并且b)当我在一个简单的代码上运行它时，它甚至似乎都不起作用我的包。我看到一位Roxygen的作者发帖说，由于Rgraphviz的依赖性，调用图的生成被禁用了，但是代码在那里。无论如何。

任何人都有更好的方法快速计算出foo称为bar，baz和qux，而qux称为quux？

编辑:基于R的配置文件系统的解决方案很棒，假设您可以实际运行代码...文件中一半的内容无法运行，而且我不知道它的作用...静态分析太多了希望，我想。

编辑2:Roxygen的调用图东西似乎基于函数表达式的递归下降并检查is.callable进行了静态分析。能够在任何功能上运行它，真是太好了……明天我可能会玩这个……

Answer 1

profr可以帮助您吗？从文档中:

> ?profr
> glm_ex <- profr(example(glm))
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>      head(glm_ex)
             f level time start  end  leaf source
8      example     1 0.32  0.00 0.32 FALSE  utils
9  <Anonymous>     2 0.04  0.00 0.04 FALSE   <NA>
10      source     2 0.28  0.04 0.32 FALSE   base
11  prepare_Rd     3 0.02  0.00 0.02 FALSE   <NA>
12      render     3 0.02  0.02 0.04 FALSE   <NA>
13 getSrcLines     3 0.02  0.04 0.06 FALSE   base
>      summary(glm_ex)
               f          level             time          start       
 eval.with.vis  :10   Min.   : 1.000   Min.   :0.02   Min.   :0.0000  
 <Anonymous>    : 3   1st Qu.: 4.000   1st Qu.:0.02   1st Qu.:0.1200  
 lazyLoadDBfetch: 3   Median : 6.000   Median :0.02   Median :0.2000  
 %in%           : 3   Mean   : 7.211   Mean   :0.03   Mean   :0.1769  
 inherits       : 3   3rd Qu.: 9.000   3rd Qu.:0.02   3rd Qu.:0.2600  
 is.factor      : 3   Max.   :22.000   Max.   :0.32   Max.   :0.3000  
 (Other)        :65                                                   
      end            leaf            source         
 Min.   :0.0200   Mode :logical   Length:90         
 1st Qu.:0.1500   FALSE:75        Class :character  
 Median :0.2400   TRUE :15        Mode  :character  
 Mean   :0.2069   NA's :0                           
 3rd Qu.:0.2800                                     
 Max.   :0.3200                                     

> plot(glm_ex)

所追求的不尽相同，但是您可以使其适应您的需求。