r - 基于数据框和向量之间的部分匹配来过滤行

Question

我有一个数据框，想要根据第一列中的名称与向量中的名称的部分匹配来过滤它。

nam <- c('mmu_mir-1-3p','mmu_mir-1-5p','mmu-mir-3-5p','mir-4','mmu-mir-6-3p') #factor
aa <- c('12854','36','5489','54485','2563') #numeric
df <- data.frame(nam,aa)

vector <- c('mir-1','mir-3','mir-6')

我需要在新数据框中包含行，其中 df$nam 中的名称与 vector 中的名称部分匹配。所以 new_df 应该看起来像这样。

new_nam <- c('mmu_mir-1-3p','mmu_mir-1-5p','mmu-mir-3-5p','mmu-mir-6-3p')  #factor
new_aa <- c('12854','36','5489','2563')  #numeric
new_df <- data.frame(new_nam,new_aa)

Answer 1

我们可以将“vector”的元素粘贴到由|折叠的单个字符串中，并在grepl或str_detect中使用它 来过滤行

library(dplyr)
library(stringr)
df %>% 
   filter(str_detect(nam, str_c(vector, collapse="|")))
#           nam    aa
#1 mmu_mir-1-3p 12854
#2 mmu_mir-1-5p    36
#3 mmu-mir-3-5p  5489
#4 mmu-mir-6-3p  2563

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在base R中，这可以通过subset/grepl来完成

subset(df, grepl(paste(vector, collapse= "|"), nam))