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我目前正在尝试寻找DNA的互补链,这意味着我必须将所有T替换为As,将As替换为Ts,将Cs替换为Gs,以及将Gs替换为Cs。我一直在尝试找到一种方法来执行此操作,该方法不会导致程序完全返回一个字母,我想我已经找到了方法,但是现在每次运行它时,我都会收到一条错误消息,告诉我将行转换为str并我无法放置在应该放置的位置或原因,这是我目前拥有的代码:
#open file with DNA strand
df = open('dnafile.txt','r')
#function for finding complementary strand
def encode(code,DNA):
for k in code:
DNA = DNA.replace(k,code[k])
print('The complementary strand is: ' + DNA)
#carrying out function
code = {ord('A'):'T', ord('T'):'A', ord('G'):'C', ord('C'):'G'}
DNA = df.read()
encode(code,DNA)
最佳答案
您将整数作为DNA.replace()
的第一个参数传递,该参数仅接受字符串; ord('A')
生成一个整数,这就是您作为k
传递的内容:
DNA = DNA.replace(k, code[k])
ord('A')
替换
'A'
,但是随后出现新问题,即
C->G
替换将撤消
G->C
替换,反之亦然。
str.translate()
method并删除循环:
def encode(code,DNA):
DNA = DNA.translate(code)
print('The complementary strand is: ' + DNA)
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我是一名优秀的程序员,十分优秀!