bash - AWK数组语法错误(意外的换行符或字符串结尾)

Question

我一直在尝试运行以下bash脚本，但出现错误:

awk: cmd. line:1: -
awk: cmd. line:1:  ^ unexpected newline or end of string

我一直试图找出问题所在，但无济于事。我需要为一个项目紧急运行脚本，因此我们将不胜感激!

输入文件(称为“输入”):

0    13    1495.015    1495.02d0    3.03607E-09    0.000000    0.00000E+00
0    14    1598.750    1598.57d0    1.90704E-09    0.000000    0.00000E+00
0    15    1701.372    1700.87d0    1.26357E-09    0.000000    0.00000E+00
0    16    1803.382    1802.22d0    9.11215E-10    0.000000    0.00000E+00
0    17    1906.131    1904.54d0    7.17855E-10    0.000000    0.00000E+00
0    18    2009.553    2007.55d0    5.88960E-10    0.000000    0.00000E+00
0    19    2113.543    2110.84d0    4.86193E-10    0.000000    0.00000E+00
0    20    2217.641    2214.16d0    4.09698E-10    0.000000    0.00000E+00
0    21    2321.638    2317.24d0    3.53609E-10    0.000000    0.00000E+00
0    22    2426.151    2420.84d0    3.12269E-10    0.000000    0.00000E+00
0    23    2530.983    2524.70d0    2.80847E-10    0.000000    0.00000E+00
0    24    2636.078    2629.18d0    2.52442E-10    0.000000    0.00000E+00

脚本开始:

largesep_obs=103.188

avg_n="`awk '{sum_n+=$2} END{avg=sum_n/NR; print(avg)}' input`"

avg_ref="`awk '{sum_ref+=$3} END{avg=sum_ref/NR; print(avg)}' input`"

avg_obs="`awk '{sum_obs+=$4} END{avg=sum_obs/NR; print(avg)}' input`"

num="`awk -v avg_n=$avg_n -v avg_obs=$avg_obs '{sum+=($4-avg_obs)*($2-avg_n); print(sum)}' input`"

den="`awk -v avg_n=$avg_n '{sum+=($2-avg_n)**2}' input`"

largesep_ref=$num/$den

r=1

nu_not=2000

b="( $r*$largesep_ref/$largesep_obs-1 )*( $r*$avg_ref/$avg_obs-1 )**-1"

den_of_a=`awk -v avg_obs=$avg_obs -v avg_ref=$avg_ref -v nu_not=$nu_not -v b="$b" '{sum+=(($4/nu_not)**b)} END{ans=sum/NR; print(ans)}' input`

a=($avg_obs - $r*$avg_ref)/$den_of_a

no_of_rows=12

awk -v nu_not=$nu_not -v r=$r -v a=$a -v b=$b -v no_of_rows=$no_of_rows '\"{
            for (x=1; x<=no_of_rows; x++) {
            array[x]=r*$3 + a*(($4/nu_not)**b)
        print("%s", vector[x])
        print("\n")
            }           
}'\" input

Answer 1

您的脚本有很多错误，很难知道从哪里开始。

前3个awk命令可以在一个脚本中完成:

avgs=(awk '{ sum_n += $2; sum_ref += $3; sum_obs +=$4; }
           END { print sum_n/NR; sum_ref/NR; sum_obs/NR }' input)
avg_n=${avgs[0]}
avg_ref=${avgs[1]}
avg_obs=${avgs[2]}

我不确定您在 num和 den的分配中正在做什么。您将输入文件输入 awk，但只是在每行上添加了相同的内容，而不对输入执行任何操作。在 num分配中，您正在打印每行的运行总计，但是稍后您将 $num当作仅包含一个数字来使用。该 print(sum)应该在 END子句中吗？另一方面， awk分配中的 den命令根本没有任何 print命令，因此没有任何分配。

b="( $r*$largesep_ref/$largesep_obs-1 )*( $r*$avg_ref/$avg_obs-1 )**-1"
a=($avg_obs - $r*$avg_ref)/$den_of_a

不执行计算，它们只是将整个公式作为字符串分配给变量。如果要计算，则需要使用 let或 ((...)):

令b =($ r * $ largesep_ref/$ largesep_obs-1)($ r $ avg_ref/$ avg_obs-1)**-1
a =(((($ avg_obs-$ r * $ avg_ref)/$ den_of_a))

最后一个 awk命令应为:

awk -v nu_not=$nu_not -v r=$r -v a="$a" -v b="$b" -v no_of_rows=$no_of_rows '{
            for (x=1; x<=no_of_rows; x++) {
            array[x]=r*$3 + a*(($4/nu_not)**b)
        print("%s", vector[x])
        print("\n")
            }           
}' input

关于 -的错误消息是由于未引用 $a而引起的-它是将 -中的 $a视为一个单独的参数，并将其解释为要读取的输入文件(意味着stdin)。但是 b=$b的扩展导致语法错误。我也看不到脚本中 \"的原因。