python - 如果列表索引超出范围python错误，则分配变量

Question

如果发现索引错误，如何将字符串传递给变量？考虑以下代码:

for l1, l2 in zip(open('file1.list'), open ('file2.list')):
  a=fasta1[int(l1)]
  b=fasta2[int(l2)]

  alignments = pairwise2.align.globalxx(a,b)
  top_aln = alignments[0]
  aln_a, aln_b, score, begin, end = top_aln
  print aln_a+'\n'+aln_b
  outfast1 = aln_a
  outfast2 = aln_b

必须导入许多这些功能(pairwise2 align)，
但是file.lists是单列文本文件，每行具有一个序列ID(文本和数字)，用于从fasta1和fasta2文本文件中提取。

基本上，我想用 try:每个列表命令( a=fasta1[int(l1)])，如果没有错误(id在范围内)，请照常进行操作(为该迭代分配变量a和b)，但是如果没有，则分配'a'变量一些占位 rune 本，例如“GGG”:

for l1, l2 in zip(open('file1.list'), open ('file2.list')):
 try:
  a=fasta1[int(l1)]
 except IndexError,e:
  a="GGG"
 continue

 try:
  b=fasta2[int(l2)]
 except (IndexError):
  b="CCC"
 continue

这段代码不太有效(当与上面的代码集成时)，鉴于我缺乏python的能力，这不足为奇，但是我不太清楚为什么。尽管有打印请求，但实际上我没有输出文本...我在考虑这个权利吗？如果索引中没有错误，我只希望它继续进行成对对齐(使用第一个a和b变量)，然后将一些文本打印到stdout。

有任何想法吗？

Answer 1

Python的conditional(又名三元)表达式可以为您将此行单行。他们经常因缺乏可读性而受到批评，但是我认为这个例子读起来足够好。

a = fasta1[int(l1)] if int(l1) < len(fasta1) else "GGG"