r - 如何调用具有同名字符变量的对象

Question

我正在尝试在 R 中编写一个函数来以类似的方式批量分析多个文件。文件属于 ExpressionSetIllumina 类.我可以使用目录中所有文件的名称创建一个字符(字符串)向量并加载每个文件:

list = list.files()
for (i in list[1]) {    
  load(i)
}

这正确加载文件

> ls()
[1] "i"                    "list"                 "SSD.BA.vsn"
> class(SSD.BA.vsn)
[1] "ExpressionSetIllumina"
attr(,"package")
[1] "beadarray"

我现在想做的是用 i (字符串 "SSD.BA.vsn" )分配对象 SSD.BA.vsn到一个新的对象数据，以便:

>data = SomeFunction(i)
>class(data)
[1] "ExpressionSetIllumina"
attr(,"package")
[1] "beadarray"

但是到目前为止，无论我尝试过什么，都只是将数据作为与 i 具有相同值的字符向量返回，或者根本不起作用。所以我想知道是否有一个函数可以为我做这件事，或者我是否需要以其他方式去做。

我将对象或变量的名称存储为字符向量中的字符串。如何使用字符串对象名称对对象执行某些操作？

Answer 1

我想你想要 get .

data <- get(i)

也就是说，一旦你开始使用 get (以及它的对应物 assign )，你通常会得到可怕的不可读代码。

对于像您这样的批量分析，通常最好将所有数据读入数据框列表，然后自由使用 lapply .就像是:

data_files <- list.files()
all_vars <- lapply(data_files, function(file)
{
  vars_loaded <- load(file)
  mget(vars_loaded, parent.frame())
})

mget是 get的版本一次检索多个变量。在这里它用于检索通过调用加载加载的所有内容。

现在您有一个列表列表:顶级列表与文件相关，低级列表包含从该文件加载的变量。