indexing - Julia /Graphs.jl : creating graph using graph() and arguments

Question

我正在尝试使用 Graphs.jl 模块从 Julia 中的图中获取子图。我有图，并将其顶点和边存储到列表中，然后我的算法在该列表中移动并删除不属于新子图的节点和边。到这一部分，一切正常，在整个算法之后，剩下的就是数组 sub_vertices type: Graphs.ExVertex[] 和数组 sub_edges 类型:Graphs.ExEdge{Graphs.ExVertex}[]。

在整个函数的末尾，我想创建子图，所以我使用:

sub_g = graph(sub_vertices, sub_edges, is_directed=false)

但是我收到Bounds() 错误。任何想法 ？我只知道问题出在边缘。

我尝试运行:

sub_g = graph(sub_vertices, Graphs.ExEdge{Graphs.ExVertex}[], is_directed=false)

并且运行正常。它使用数组sub_vertices给定的顶点创建图形。使用 sub_edges 添加边时会出现问题。

其他信息:顶点和边是原始图的精确副本。这意味着索引、标签等属性与原始图中相同。我认为也许顶点索引会出现问题，但这并不是因为当我运行时，

sub_g = graph(sub_vertices, Graphs.ExEdge{Graphs.ExVertex}[], is_directed=false)

运行正常。打印顶点后，它们有索引，例如 1,3,5，但看起来没问题。所以我不知道为什么边缘会产生边界错误。

Answer 1

使用图构造函数来获取子图可能不是一个好主意。我不太熟悉 Graphs.jl，但我曾在 Julia 中使用过图表。

构造函数可能会为sub_vertices分配新的索引。例如，如果 sub_vertices 为 [5,6,9]，则新图表仍将使用 [1,2,3]。如果您的边列表为[5=>6, 6=>9, 9=>5]，您会发现所有边都无效，因为子图只有顶点[ 1,2,3]。

我建议您使用专用的子图方法来完成您想要做的事情，分两个阶段:

1. 首先，使用您隔离的sub_edges计算子图。
2. 接下来，使用sub_vertices计算子图。

Graft.jl有一个方法可以让您同时执行这两项操作:

  julia> using Graft

  julia> g = completegraph(10)
         Graph(10 vertices, 90 edges, Symbol[] vertex properties, Symbol[] edge properties)

  julia> sg = subgraph(g, [5,6,9], [5=>6, 6=>9, 9=>5])
         Graph(3 vertices, 3 edges, Symbol[] vertex properties, Symbol[] edge properties)

  julia> vertices(sg)
         1:3

  julia> edges(sg)
         3-element Graft.EdgeIter:
            1=>2
            2=>3
            3=>1

或者如果您希望顶点保留其原始标签

  julia> g = completegraph(10)
         Graph(10 vertices, 90 edges, Symbol[] vertex properties, Symbol[] edge properties)

  julia> setlabel!(g, collect(1:10)) # Label the vertices

  julia> sg = subgraph(g, [5,6,9], [5=>6, 6=>9, 9=>5])
         Graph(3 vertices, 3 edges, Symbol[] vertex properties, Symbol[] edge properties)

  julia> encode(sg)
         3-element Array{Int64,1}:
            5
            6
            9

  julia> encode(sg, edges(sg))
         3-element Array{Pair{Int64,Int64},1}:
            5=>6
            6=>9
            9=>5